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分子植物育种,2024年,第22卷,第1期,第48-60页
MolecularPlantBreeding2024.
Vol.22,No.1,48-60
研究报告
ResearchReport
5种十字花科植物KEA基因家族的全基因组鉴定和比较进化分析
刘丹青1
郭力1金玉环1文李永光1黄先忠12*
0
1石河子大学生命科学学院,特色植物基因组学实验室,石河子,832003;2安徽科技学院农学院,作物生物技术研究中心,凤阳,23310
*通信作者,huangxz@
摘要K+/H+逆向转运蛋白通过调节细胞内K+和pH稳态,在植物的营养、生长、发育和信号转导中发挥重
要作用。在本研究中,利用全基因组分析5种十字花科植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)、琴叶拟南芥(Ara-
bidopsislyrata)、小鼠耳芥(Arabidopsispumila)、亚麻荠(Camelinasativa)和盐芥(Eutremasalsugineum)分别鉴定
出6、6、12、18和6个KEA基因。系统进化、基因结构和motif分析表明以上48个KEA基因隶属于CladeI
和CladeⅡI两个亚家族。共线性分析发现,在小鼠耳芥和亚麻荠进化中,KEA家族成员既经历了全基因组复
制同时又经历了片段重复事件,而拟南芥、琴叶拟南芥和盐芥中大部分KEA成员以经历分散型复制事件为
主。比较进化分析表明5种植物KEA家族的旁系同源基因在进化中的主要动力为纯化选择。物种间KEA基
因的共线性分析表明十字花科物种之间存在复杂的进化关系。小鼠耳芥KEA基因的表达明显响应高盐胁
迫,其中ApKEA2.1/2.2、ApKEA6.1/6.2的表达模式存在明显差异,暗示复制基因对功能发生分歧。本研究是
对植物中K+/H+逆向转运蛋白的新认识,研究结果为进一步研究K/H+平衡与钾素动态营养机制提供了基因
资源和理论基础。
关键词小鼠耳芥;KEA基因家族;十字花科;进化;基因表达
Genome-wideIdentificationandComparativeEvolutionaryAnalysisofthe
KEAGeneFamilyinFiveBrassicaceaePlantSpecies
GuoLilJinYuhuan!LiuDanqingLiYongguangHuangXianzhongl.2
1SpecialPlantGenomicsLaboratory,CollegeofLifeSciences,ShiheziUniversity,Shihezi,832003;2CenterforCropBiotechnology,CollegeofAgri-
culture,AnhuiScienceandTechnologyUniversity,Fengyang,233100
*Correspondingauthor,huangxz@
DOI:10.13271/j.mpb.022.000048
AbstractK+effluxantiporterplaysanimportantroleinintracellularK+andpHhomeostasis,andfunctionin
plantnutrition,growth,developmentandsignaltransduction.Inthisstudy,genome-wideanalysisidentified6,6,
12,18and6KEAgenesinfiveBrassicaceaeplants,Arabidopsisthaliana,Arabidopsislyrate,Arabidopsispumila,
CamelinasativaandEutremasalsugineum,respectively.Phylogeneticevolution,genestructure,andmotifanalyses
showedthat48KEAgeneswereclassifie
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