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分子植物育种，2024年，第22卷，第5期，第1430-1443页

MolecularPlantBreeding2.24Vol.22,No.5,1430-1443

研究报告

ResearchReport

甜瓜MADS-box基因家族的鉴定及系统进化分析

秦玉杰任辉祝建波*

石河子大学生命科学学院，石河子，832000

*通信作者，274831213@

摘要中国是甜瓜的主要生产国家，种植面积和产量都位于世界首位。本研究通过全基因组分析鉴定了

甜瓜MADS-box基因家族成员，分析甜瓜MADS-box基因家族成员的染色体定位、多重序列比对、motif分

布和外显子－内含子结构分布，以及对其成员进行进化及表达分析，并分析启动子区的顺式作用元件分布。

结果显示，从甜瓜全基因组数据库中共鉴定了45个甜瓜MADS-box基因，其中I型基因11个，ⅡI型基因

34个；通过系统发育分析，I型基因主要分布于Mβ和M亚家族中；Ⅱ型基因则分布于13个亚家族；I型

基因与Ⅱ型基因的motif分布和外显子个数区别明显，但同型基因区别不大；对CmMADS-box基因家族全生理

期表达量进行可视化分析并进行了共线性分析；根据启动子区的顺式作用元件分布情况，推测CmMADS-box

基因可能响应多种外界胁迫，即具有功能多样性。该研究结果为探究甜瓜MADS-box基因家族生物学功能

提供参考。

关键词MADS-box；甜瓜；基因家族；进化分析；表达分析

IdentificationandPhylogeneticAnalysisofMADS-boxGeneFamilyin

CucumismeloL.

QinYujieRenHuiZhuJianbo*

CollegeofLifeScience,ShiheziUniversity,Shihezi,832000

*Correspondinauthor.274831213@

DOI:10.13271/j.mpb.022.001430

AbstractChina,inwhichliestheworldsbiggestplantingarea,becomingthemainproducerofmuskmelonand

theyieldranksfirst.Basedongenome-wideanalysis,weidentifiedthemembersofMADS-boxgenefamilyin

melon.Thechromosomallocation,multiplesequencealignment,motifdistribution,exon-intronstructure,phyloge-

ny,expressionpatternandcis-actingelementsdistributionofMADS-boxgenefamilymemberswereanalyzed.

Theresultsshowedthat45CmMADS-boxgeneswereidentifiedfromthewholegenomedatabaseofmelon,among

whichthereare11loftypeIgenesand34oftypeIIgenes.Accordingtophylogeneticanalysis,typeIgenesare

mainlydistributedinMβandMsubfamiliesandtypeIIgenesaredistributedin13subfamilies.Themotifdistri-

butionandthenumberofexonsoftypeIgeneandtypeIIgenearedifferent,butthedifferenceofhomotypegenes

isnotsignificant.TheexpressionofCmMADS-boxgenefamilywasperformedvisualanalysisduringthewhole

physiologicalperiod.Accordingtothepredictionofcis-actingelementsinthepromoterregion,theCmM