东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析.pdfVIP

福建农林大学学报(自然科学版)ｈｔｔｐ://ｊｆａｆｕ.ｆａｆｕ.ｅｄｕ.ｃｎ第５３卷第３期

ＪｏｕｒｎａｌｏｆＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ(ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ)２０２４年５月

引用格式:张凯遥ꎬ冯佩林ꎬ宓诗雨ꎬ等.东方蜜蜂微孢子虫ＲＲＤＲＰ的分子特性及系统进化分析[Ｊ].福建农林大学学报(自然科学版)ꎬ２０２４ꎬ

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５３(３):３７１３７６.

ＺＨＡＮＧＫＹꎬＦＥＮＧＰＬꎬＦＵＳＹꎬｅｔａｌ.ＩｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎｏｆｍｏｌｅｃｕｌａｒｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓａｎｄｐｈｙｌｅｔｉｃｅｖｏｌｕｔｉｏｎｏｆＮｏｓｅｍａｃｅｒａｎａｅＲＲＤＲＰ[Ｊ].Ｊｏｕｒｎａｌｏｆ

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ＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ(ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ)ꎬ２０２４ꎬ５３(３):３７１３７６.

东方蜜蜂微孢子虫ＲＲＤＲＰ的分子特性

及系统进化分析

１１１１１１１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３

张凯遥ꎬ冯佩林ꎬ宓诗雨ꎬ郭思佳ꎬ张艺琼ꎬ荆欣ꎬ陈大福ꎬ郭睿ꎬ付中民

(１.福建农林大学蜂学与生物医药学院ꎻ２.福建农林大学天然生物毒素国家地方联合工程实验室ꎻ

３.福建省蜂疗研究所ꎬ福建福州３５０００２)

摘要:【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Ｒａｄ１８￣ｌｉｋｅ重组与ＤＮＡ修复蛋白(Ｒａｄ１８￣ｌｉｋｅｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎａｎｄＤＮＡ

ｒｅｐａｉｒｐｒｏｔｅｉｎꎬＲＲＤＲＰ)进行系统进化分析ꎬ为进一步研究其功能提供理论依据ꎮ【方法】利用Ｐｒｏｔｐａｒａｍ、ＰｒｏｔＳｃａｌｅ和ＳＷＩＳＳ￣

ｍｏｄｅｌ等软件分析ＲＲＤＲＰ的理化性质、亲水性和三级结构ꎮ利用ＳｉｇｎａｌＰ４.１Ｓｅｒｖｅｒ、ＮｅｔＰｈｏｓ３.１Ｓｅｒｖｅｒ、ＴＭＨＭＭ和ＳＯＰＭＡ

等软件预测ＲＲＤＲＰ的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构ꎮ使用ＰＳＯＲＴⅡ软件预测ＲＲＤＲＰ蛋白的亚细胞定位ꎮ

使用ＭＥＭＥ软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种ＲＲＤＲＰ的保守基序ꎮ通过Ｍｅｇａ１１.０软件对东方蜜蜂微孢子虫和其

他物种的ＲＲＤＲＰ进行氨基酸序列多重比对ꎬ并采用邻接法构建系统进化树ꎮ【结果】东方蜜蜂微孢子虫ＲＲＤＲＰ基因含有

２９２８个核苷酸ꎬ可编码９７５个氨基酸ꎬ分子质量约１１.５０ｋｕꎬ脂溶系数９３.５８ꎬ等电点６.６３ꎬ分子式ＣＨＮＯＳꎬ平

５１３５８２５３１３７７１５４５３４

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均亲水系数为０.６２７ꎬ可同时定位于细胞核、细胞质、过氧化物酶体和细胞骨架ꎻＲＲＤＲＰ包含５５个磷酸化位点、６７８个α￣螺

旋、９９条延长链、２２个β￣转角及１７６个无规则卷曲ꎻＲＲＤＲＰ不含信号肽与跨膜结构域ꎮ东方蜜蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子

虫、颗粒病微粒子虫等１１个物种的ＲＲＤＲＰ中均含有５个相同的保守基序(Ｍｏｔｉｆ１、Ｍｏｔｉｆ２、Ｍｏｔｉｆ３、Ｍｏｔｉｆ４和Ｍｏｔｉｆ５)ꎮ东

方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微粒子虫在进化树上聚为一支ꎬ同源性较高ꎮ【结论】东方蜜蜂微孢子虫ＲＲＤＲＰ是潜在的亲水

性蛋白和胞内蛋白ꎬ在东方蜜蜂微孢子虫以及其他微孢子虫和真菌中高度保守ꎮ

关键词:东方蜜蜂微孢子虫ꎻ染色体结构维持蛋白ꎻＲａｄ１８￣ｌｉｋｅ重组和ＤＮＡ修复蛋白ꎻ分子特性ꎻ

系统进化

中图分类号:Ｓ８９５