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2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在元转录组学中的作用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题

1.下列哪项不属于元转录组学的研究范畴？

A.分析特定环境样品中所有生物的总转录本

B.研究不同组织类型中基因表达的模式

C.探究微生物群落的功能特征

D.揭示群落成员之间的分子互作机制

2.在元转录组学数据处理中，去除宿主转录本的主要目的是？

A.提高测序深度

B.降低数据复杂性，专注于研究目标生物的转录本

C.增加数据量

D.改善序列比对质量

3.下列哪个生物信息学工具主要用于序列比对？

A.DESeq2

B.BLAST

C.GOseq

D.KEGGMapper

4.MetaCyc数据库主要用于？

A.差异表达基因分析

B.功能基因注释

C.宿主基因组组装

D.元基因组序列拼接

5.下列哪项技术常用于构建宏转录组文库？

A.PCR扩增

B.高通量测序

C.基因芯片

D.原位杂交

6.元转录组学分析中，alpha多样性通常用来衡量什么？

A.群落中物种的丰富度

B.群落中基因的丰度

C.群落中转录本的多样性

D.群落功能的多样性

7.下列哪个指标可以用来评估测序数据的质量？

A.基因数量

B.碱基覆盖率

C.Q值

D.差异表达基因数量

8.在元转录组学研究中，功能富集分析的目的是？

A.确定哪些基因在特定群落中差异表达

B.识别群落中具有相似表达模式的基因

C.推断群落整体的功能特征和代谢能力

D.分析基因之间的相互作用网络

9.下列哪项方法可以用于检测元转录组数据中的生物标志物？

A.主成分分析(PCA)

B.机器学习算法

C.序列聚类

D.基因表达量标准化

10.元转录组学研究的优势之一是？

A.只能研究特定物种的转录本

B.成本低廉，易于操作

C.可以提供群落功能活动的动态信息

D.只能分析短期实验数据

二、填空题

1.元转录组学是研究特定环境中所有______转录本的总和。

2.常用的元转录组学数据分析流程包括：数据______、序列______、宿主转录本去除、差异表达分析、功能注释和______。

3.差异表达分析可以帮助我们识别在不同条件下______或______的基因。

4.GO(GeneOntology)数据库用于对基因进行______、______和______的注释。

5.热图是一种常用的可视化工具，可以用来展示______的差异表达模式。

三、简答题

1.简述元转录组学与传统转录组学的区别。

2.解释什么是宏转录组，并列举两种获取宏转录组数据的方法。

3.简述元转录组学在微生物群落功能研究中的应用。

4.列举三种常用的元转录组学数据分析工具，并简述其功能。

四、论述题

1.设计一个研究人体肠道菌群元转录组学的方案，包括研究目的、样本采集、数据处理和分析方法等。

2.讨论元转录组学在环境监测中的应用前景和面临的挑战。

试卷答案

一、选择题

1.B

解析：元转录组学关注的是特定环境中所有生物的总转录本，而不仅仅是特定组织类型。A、C、D都属于元转录组学的研究范畴。

2.B

解析：去除宿主转录本是元转录组学数据处理中的关键步骤，目的是降低数据复杂性，将分析重点放在研究目标生物（通常是微生物）的转录本上。

3.B

解析：BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)是一种常用的序列比对工具，用于在数据库中寻找与查询序列相似的序列。A、C、D分别是用于差异表达分析、功能注释和基因组/基因映射的工具。

4.B

解析：MetaCyc数据库是一个综合性的数据库，主要存储和整理关于天然产物及其生物合成途径的信息，常用于功能基因注释和代谢途径分析。A、C、D分别用于差异表达分析、宿主基因组组装和宏基因组序列拼接。

5.B

解析：高通量测序是获取宏转录组数据的常用方法，通过大规模平行测序技术读取样品中所有生物转录本的序列信息。A、C、D不是构建宏转录组文库的主要技术。

6.A

解析：alpha多样性是指群落中物种（或在这里是基因/转录本）的丰富度，通常用物种数量或基因数量来衡量。B、C、D分别指基因丰度、转录本多样性和群落功能多样性，通常用其他指