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2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在免疫细胞表观遗传调控中的作用
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分。请将正确选项的首字母填入括号内)
1.下列哪一项不属于免疫细胞的表观遗传调控标记?
A.DNA甲基化
B.组蛋白乙酰化
C.microRNA表达
D.染色质结构重塑
2.在研究T细胞分化过程中特定转录因子的作用机制时,哪一种生物信息学分析方法最适合用于鉴定其直接结合的DNA序列区域?
A.RNA-Seq差异分析
B.ATAC-seq可及性分析
C.ChIP-seq结合位点鉴定
D.DNA甲基化水平变化分析
3.对于大规模的ChIP-seq数据集,哪一项生物信息学工具或软件包通常用于识别核小体重叠的区域(peaks)?
A.SAMtools
B.HISAT2
C.MACS2
D.Bowtie2
4.在整合分析多个组学数据(如DNA甲基化、组蛋白修饰、转录本序列)以构建免疫细胞表观遗传调控网络时,以下哪种方法或策略是常用的?
A.仅进行单一组学数据的统计分析
B.基于已知通路数据库进行功能注释
C.利用图论方法构建交互网络
D.仅依赖热图可视化展示关联性
5.DNA序列比对工具(如BLAST,Bowtie,HISAT2)在生物信息学分析中的主要作用是?
A.定量检测表观遗传标记的丰度
B.识别基因组中特定序列的定位和相互作用
C.将测序读段(reads)与参考基因组或数据库进行比对
D.分析非编码RNA的二级结构
6.以下哪项技术能够提供单细胞分辨率的免疫细胞表观遗传学信息?
A.传统基因组测序
B.空间转录组测序
C.单细胞ChIP测序(scChIP-seq)
D.粗略分选的免疫细胞ATAC测序
7.在生物信息学分析中,UCSC基因组浏览器主要被用于?
A.对原始测序数据进行预处理和过滤
B.可视化展示多种组学数据(如基因组、转录组、表观遗传组)在基因组上的分布
C.预测基因的功能和表达调控机制
D.进行大规模的基因组序列比对
8.组蛋白修饰(如H3K4me3,H3K27ac)的鉴定通常依赖于哪种生物信息学分析方法?
A.DNA序列特征比对分析
B.甲基化特异性PCR(MS-PCR)数据分析
C.通过ChIP-seq技术获得修饰位点后进行PeakCalling和Motif分析
D.蛋白质组学质谱数据分析
9.生物信息学在解析免疫细胞表观遗传变异与自身免疫病关联方面的一个重要应用是?
A.预测新药靶点
B.识别疾病相关的特定表观遗传标记或模式
C.构建疾病相关的蛋白质相互作用网络
D.测量患者体内免疫细胞的绝对数量
10.机器学习或人工智能技术在免疫细胞表观遗传数据分析中的应用潜力主要体现在?
A.完全自动化地从原始测序数据中直接解读生物学意义
B.预测未知表观遗传标记的功能及其在疾病中的作用
C.仅用于可视化复杂的数据关系
D.仅用于提高计算速度
二、填空题(每空2分,共20分。请将答案填入横线处)
1.表观遗传调控通常不涉及DNA序列的__________改变,但可以影响基因的表达状态。
2.ChIP-seq数据分析流程通常包括__________、PeakCalling、Motif发现和功能富集分析等主要步骤。
3.DNA甲基化主要发生在胞嘧啶的__________位上,形成的5mC修饰可以通过__________等酶介导进一步转化为5hmC。
4.ATAC-seq技术通过检测__________填充的测序读段,来评估染色质的可及性区域,从而间接反映组蛋白修饰和染色质结构状态。
5.在生物信息学研究中,将多个来源的数据整合到一起进行分析,以获得单一数据集无法提供的更全面信息的方法称为__________。
6.microRNA(miRNA)虽然属于非编码RNA,但它们可以通过__________等机制参与对靶基因转录后水平的调控。
7.评估生物信息学分析结果可靠性的一个重要指标是__________,即分析结果的可重复性。
8.解析免疫细胞发育和分化过程中表观遗传调控网络,需要综合分析不同__________、不同__________的表观遗传标记变化。
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