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2025年大学《生物信息学、生物数据库原理》考试备考试题及答案解析

一、单项选择题（每题2分，共20分）

1.以下哪类数据库属于二次生物数据库？

A.GenBank（核酸序列）

B.UniProt（蛋白质序列）

C.KEGG（代谢通路）

D.PDB（蛋白质结构）

答案：C

解析：一次数据库直接存储原始实验数据（如GenBank的DNA序列、UniProt的蛋白质序列、PDB的三维结构坐标），二次数据库通过整合、注释或关联一次数据形成功能化信息（如KEGG整合代谢通路、基因功能等信息）。

2.下列关于BLAST算法的描述，错误的是？

A.采用启发式搜索策略提高速度

B.优先寻找短长度的高匹配片段（种子）

C.适用于全局序列比对

D.E值越小表示匹配结果越可靠

答案：C

解析：BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是局部比对工具，用于寻找序列中的局部相似区域；全局比对通常使用Needleman-Wunsch算法。

3.构建生物数据库时，数据标准化的核心目的是？

A.减少存储空间占用

B.确保不同来源数据的可整合性

C.提高数据查询速度

D.满足用户界面美观需求

答案：B

解析：生物数据来源多样（如高通量测序、质谱、文献），标准化（如使用统一标识符、遵循国际格式标准）是实现跨数据库检索和分析的基础。

4.在蛋白质结构预测中，同源建模法的关键前提是？

A.目标蛋白与已知结构蛋白有相同功能

B.目标蛋白与已知结构蛋白序列相似度≥30%

C.目标蛋白的晶体衍射数据已获取

D.目标蛋白属于膜蛋白家族

答案：B

解析：同源建模依赖已知结构的同源蛋白（通常序列相似度30%）作为模板，通过序列比对构建目标蛋白的三维结构模型。

5.以下哪种数据不属于生物数据库的典型存储对象？

A.单细胞RNA测序的表达矩阵

B.临床样本的病理图像

C.文献中的基因功能描述

D.实验室设备的采购记录

答案：D

解析：生物数据库聚焦生物相关数据（分子序列、组学数据、功能注释、实验结果等），实验室设备记录属于管理类数据，通常不纳入生物数据库核心存储范畴。

6.关于FASTA格式的描述，正确的是？

A.第一行以“”开头，包含序列标识符和描述

B.仅支持DNA序列存储，不支持蛋白质序列

C.必须使用双字节编码保存

D.序列部分可以包含空格分隔

答案：A

解析：FASTA格式第一行以“”起始（如gi|12345|emb|X12345.1|），后续行为连续的序列字符（DNA/RNA用A/T/C/G/U，蛋白质用单字母氨基酸代码），无空格或特殊符号。

7.在基因组注释中，CDS（编码序列）的识别主要依赖？

A.GC含量分析

B.开放阅读框（ORF）预测

C.启动子区域甲基化水平

D.非编码RNA的二级结构

答案：B

解析：CDS是mRNA中编码蛋白质的部分，其识别需找到起始密码子（ATG）到终止密码子（TAA/TAG/TGA）的连续ORF，排除内含子干扰。

8.生物数据库设计中，ER模型（实体-关系模型）的主要作用是？

A.优化数据库查询语句性能

B.描述数据实体间的关联关系

C.压缩存储大文件（如BAM格式）

D.实现数据的加密传输

答案：B

解析：ER模型通过实体（如“基因”“样本”）、属性（如基因ID、长度）和关系（如“基因-样本”的表达量关联）可视化数据库的逻辑结构，是概念设计阶段的关键工具。

9.下列哪项技术常用于生物数据的质量控制？

A.主成分分析（PCA）降维

B.碱基错误率（Q值）计算

C.系统发育树构建

D.分子动力学模拟

答案：B

解析：测序数据质量控制中，Q值（Phred质量分数）表示碱基正确的概率（如Q30表示错误率为0.1%），是评估数据可靠性的核心指标。

10.在代谢通路数据库（如Reactome）中，“反应”实体通常关联的信息不包括？

A.参与的酶（EC编号）

B.底物与产物的化学结构

C.细胞亚定位（如线粒体）

D.实验论文的DOI编号

答案：D

解析：代谢通路数据库聚焦反应的生物学过程（酶、底物、定位），实验论文的引用信息通常存储在文献数据库（如PubMed）或单独的“引用”表中。

二、填空题（每空1分，共15分）

1.国际三大核酸序列数据库协作组织包括______、______和DDBJ（日本DNA数据库）。

答案：GenBank（美国）、ENA（欧洲核酸数据库）

2.蛋白质结构数据库PDB中，结构解析方法主要包括X射线晶体学、______和______。

答案：核磁共振（NMR）、冷冻电镜（Cryo-EM）

3.生物信息学中，常用______