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■比速率细胞生长的比速率为?:底物消耗的比速率为qs∶产物形成的比速率为qp:第61页,共124页,星期日,2025年,2月5日■比速率氧消耗的比速率为qo:二氧化碳生成的比速率为qc:发酵热生成的比速率:第62页,共124页,星期日,2025年,2月5日二、化学计量学(stoichiometry)1、化学计量方程表示通用化了的碳源根据元素分析得出的细胞组成表示产物第63页,共124页,星期日,2025年,2月5日2、产率系数(yieldcoefficients)(1)宏观产率系数宏观产率系数(或称得率系数)Yi/j是化学计量学中一种非常重要的参数,常用于对碳源等底物形成菌体或产物的潜力进行评价,其中i表示菌体或产物,j表示底物例如,菌体对底物的产率系数可表示为:第64页,共124页,星期日,2025年,2月5日生物反应过程中宏观产率系数的定义总览第65页,共124页,星期日,2025年,2月5日■有时,以摩尔为单位表示产率系数更有利:
相似的概念可用于表达重要的常数:摩尔产率系数在实践中对推导元素平衡方程很重要,对与氧化磷酸化有关的理论问题也有重要意义第66页,共124页,星期日,2025年,2月5日(2)理论代谢产物产率假设发酵过程中完全没有菌体生成,则YP/S可达理论最高值,称为理论代谢产物产率(a)根据化学计量关系计算例如,由葡萄糖、氨和氧生成谷氨酸的化学计量方程为∶依此计算=147/180=0.82此处没有考虑反应过程中NADH及ATP等辅助底物的生成和消耗第67页,共124页,星期日,2025年,2月5日(b)由生物化学计量关系计算根据由底物生成目标代谢产物的代谢途径,进行代谢过程中有关NAD(P)+和ATP等辅底物的物料衡算,结合化学计量关系可求出上式:由该反应式得=(147×13)/(12×180)=0.75此处?-酮戊二酸的氨基化还原反应中所需要的NADPH由异柠檬酸脱氢反应供给,用生化计量式时,必须清楚有关的代谢途径第68页,共124页,星期日,2025年,2月5日(3)实际发酵过程中的产率系数在实际发酵中,产率是变化的,产率取决于下列因素:Y=f(菌株、底物、?、m、S;t、tm、OTR、C/N,P/O)式中m为混合度,S为底物浓度,t为平均滞留时间,tm为混合时间,OTR为氧传递速度,C/N为碳氮比,P/O为磷氧比第69页,共124页,星期日,2025年,2月5日另外,Papoutsakis和Lim(1981)用碳流分支的概念来解释菌体产率变化的原因:其中r1和r2分别为碳源分支代谢途径1和途径2的反应速度,MX和MS为菌体和底物的分子量,?x是S→X反应的化学计量系数,可见产率只随r2或r1变化在甲基营养菌中存在两种不同的碳代谢流:同化(r2)和氧化(r1)碳源和其它营养物的浓度或温度、pH等培养条件的任何变化都可能引起r2或r1变化这一概念表明,甲基营养菌菌体产率的变化是一个动力学问题,而不是生物合成问题第70页,共124页,星期日,2025年,2月5日3、化学计量的数学模型
(StoichiometricMathematicalmodels)细胞培养系统非常复杂,在过程中有许多的输入和输出。而且和化学反应不同的是,在过程中,催化剂本身是在不断繁殖的;相比较而言,化学反应过程则要简单得多。第71页,共124页,星期日,2025年,2月5日一级反应(firstorderchemicalreaction)动力学数学模型一级反应的方程式底物消耗动力学产物生产动力学方程第72页,共124页,星期日,2025年,2月5日由(2)推导底物浓度随时间变化的模型第73页,共124页,星期日,2025年,2月5日由(5)推导产物浓度随底物浓度变化的模型P2=n(S1-S2)+P1第74页,共124页,星期日,2025年,2月5日三、分批发酵动力学
(kineticsofbatchfermentation)Xistheconcentrationofbiomassinthebioreactor.Biomassconcentrationsaretypicallyexpresseding/lofDryweight.细胞生长动力学模型μisthespecificgrowthrate.第75页,共124页,星期日,2025年,2月5日Bysplittingthev
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