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真核基因表达与调控

1.真核基因表达调控的特点是什么？

真核基因表达调控具有以下特点：

多层次性：包括染色质水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平等多个层次的调控。

复杂性：涉及众多的顺式作用元件（如启动子、增强子等）和反式作用因子（转录因子等）之间的相互作用。

细胞特异性或组织特异性：不同细胞或组织中基因表达模式不同，以满足其特定的功能需求。

时空特异性：基因表达在生物体发育的不同阶段和不同时间有差异。

2.简述染色质结构对真核基因表达的影响。

染色质的基本结构单位是核小体，其结构状态影响基因表达：

异染色质状态：高度浓缩，DNA与组蛋白结合紧密，基因通常不表达。例如，在间期细胞核中，一些重复序列区域处于异染色质状态，基因沉默。

常染色质状态：相对松散，有利于转录因子等与DNA结合，促进基因表达。染色质重塑复合物可以改变核小体的位置和结构，使启动子等区域暴露，便于转录起始。如SWI/SNF复合物能利用ATP水解的能量改变核小体的位置，增加基因的可及性。

3.什么是DNA甲基化，它如何调控真核基因表达？

DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的作用下，将甲基基团添加到DNA分子的特定碱基上，通常是CpG岛中的胞嘧啶。

抑制基因表达：甲基化的DNA可以招募甲基结合蛋白，这些蛋白与染色质相互作用，使染色质结构变得更紧密，阻碍转录因子与DNA结合，从而抑制基因转录。例如，在肿瘤发生过程中，一些抑癌基因的启动子区域发生高甲基化，导致抑癌基因沉默。

影响基因印记：在配子发生过程中，某些基因会根据亲代来源进行特异性的甲基化修饰，从而使这些基因只表达父源或母源的等位基因，如胰岛素样生长因子2（IGF2）基因，父源等位基因表达，母源等位基因因甲基化而沉默。

4.组蛋白修饰有哪些类型，如何影响真核基因表达？

组蛋白修饰类型包括：

甲基化：可以发生在组蛋白的不同氨基酸残基上，如H3K4、H3K9等。H3K4甲基化通常与基因激活相关，而H3K9甲基化与基因沉默有关。

乙酰化：一般使染色质结构变得松散，增加基因的可及性，促进基因表达。例如，组蛋白乙酰转移酶（HAT）可以将乙酰基添加到组蛋白上，使染色质从紧密状态转变为松散状态。

磷酸化：改变染色质的结构和功能，影响转录因子与染色质的相互作用。如组蛋白H3的磷酸化与基因转录的起始和有丝分裂过程相关。

5.真核基因的启动子有哪些元件，各有什么作用？

真核基因启动子包含以下常见元件：

TATA盒：位于转录起始点上游约25bp处，是RNA聚合酶II结合的核心区域，决定转录起始的精确位置。

CAAT盒：通常位于70～80bp处，与转录因子结合，增强转录效率。

GC盒：常见于90bp附近，含有GGGCGG序列，可与转录因子SP1结合，促进基因转录。

6.增强子的作用特点是什么？

远距离作用：可以在距离启动子很远的位置发挥作用，甚至可以位于基因的内含子或下游区域。

无方向性：增强子的作用不受其与启动子相对方向的影响，正向或反向都能增强转录。

组织特异性：不同的增强子在不同的组织或细胞中发挥作用，决定基因的组织特异性表达。例如，免疫球蛋白基因的增强子在B淋巴细胞中具有活性，促进免疫球蛋白基因的表达。

7.什么是转录因子，它如何调控真核基因转录？

转录因子是能够结合在基因启动子或增强子等顺式作用元件上，调节基因转录的蛋白质。

结合DNA：转录因子通过其DNA结合结构域（如锌指结构、螺旋转角螺旋结构等）与特定的DNA序列结合。

招募其他蛋白：通过其转录激活或抑制结构域，招募RNA聚合酶、染色质重塑复合物、组蛋白修饰酶等，影响转录起始复合物的形成和染色质结构，从而调控基因转录。例如，转录因子p53可以结合到靶基因的启动子区域，招募转录相关蛋白，促进细胞周期调控和凋亡相关基因的表达。

8.简述真核基因转录起始复合物的形成过程。

转录因子结合：首先，通用转录因子TFIID中的TBP（TATA结合蛋白）识别并结合到启动子的TATA盒上，随后其他通用转录因子（如TFIIA、TFIIB等）依次结合，形成前起始复合物。

RNA聚合酶结合：RNA聚合酶II与前起始复合物结合，形成转录起始复合物。

复合物激活：在转录激活因子和染色质重塑等作用下，转录起始复合物发生构象变化，启动基因转录。

9.什么是选择性剪接，它对真核基因表达有什么意义？

选择性剪接是指一个基因的初级转录本在不同的条件下，通过选择不同的剪接位点，产生多种不同的成熟mRNA异构体的过程。

增加蛋白质组的复杂性：一个基因可以通过选择性剪接产生多种蛋白质异构体，增加了蛋白质的多样性，扩大了基因的编码能力。例如，果蝇的DSCAM基因通过选择性剪接可以产生约3