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2025年大学《整合科学》专业题库——基因表达谱系列分析在疾病诊断中的应用
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、名词解释(每题2分,共10分)
1.基因表达谱
2.差异表达分析
3.转录组测序(RNA-seq)
4.生物标志物
5.批次效应
二、填空题(每空1分,共15分)
1.基因表达谱分析通常涉及比较不同_______或相同条件下不同_______的基因表达水平。
2.RNA测序技术能够提供更全面的转录本信息,包括_______、可变剪接体以及_______。
3.在疾病诊断应用中,理想的生物标志物应具备高_______、高_______和良好的稳定性。
4.差异表达分析常用的统计方法包括_______检验和_______检验等。
5.基因表达谱数据分析流程通常包括数据质控、_______、差异表达基因筛选、_______和功能注释等主要步骤。
6.为了减少批次效应对结果的影响,常采用_______或_______等方法进行数据标准化。
7.基因表达谱可用于肿瘤的_______分型,有助于理解肿瘤的异质性和指导个体化治疗。
三、简答题(每题5分,共20分)
1.简述RNA测序(RNA-seq)技术相比传统基因芯片技术的优势。
2.简述在利用基因表达谱进行疾病诊断时,发现和验证生物标志物的一般流程。
3.简述什么是批次效应,并列举至少两种减少批次效应的方法。
4.简述基因表达谱分析在疾病预后评估中可能的应用方向。
四、论述题(每题10分,共20分)
1.论述基因表达谱系列分析在精准医疗背景下,为疾病诊断带来的机遇与挑战。
2.结合你所了解的某个具体疾病(如癌症),论述基因表达谱分析是如何帮助提高诊断效率和准确性的,并分析其临床转化过程中可能遇到的主要障碍。
试卷答案
一、名词解释
1.基因表达谱:指一个生物体、组织或细胞在特定时间、特定条件下所表达的全部或部分基因的转录本(通常是mRNA)丰度的集合。
**解析思路:*考察对核心概念“基因表达谱”定义的掌握,要求学生理解其本质是基因表达水平的整体描绘。
2.差异表达分析:指通过生物信息学方法比较不同实验组(如疾病组与正常组)间基因表达水平存在显著差异的过程。
**解析思路:*考察对差异表达分析基本概念的掌握,理解其目的是识别在不同状态下活跃程度发生改变的基因。
3.转录组测序(RNA-seq):指利用高通量测序技术对生物体全部或部分转录本(主要是mRNA)进行测序,以揭示其转录组结构和表达水平的分析方法。
**解析思路:*考察对RNA-seq技术原理和含义的掌握,理解其作为获取基因表达谱的一种重要技术手段。
4.生物标志物:指能够客观测量和量化,能够指示正常生理或病理过程,或者对疾病诊断、预后判断、治疗反应监测等具有预测或判断意义的生物分子(如基因、蛋白质、代谢物等)。
**解析思路:*考察对生物标志物定义及其在疾病诊断中作用的理解,要求学生明确其测量性、指示性和预测性特征。
5.批次效应:指在生物实验中,由于样本处理、实验操作或仪器平台等差异,导致不同实验批次间数据产生系统性偏差的现象,可能掩盖真实的生物学差异。
**解析思路:*考察对批次效应概念及其潜在影响的理解,认识到其在基因表达谱分析中是需要关注和解决的关键问题。
二、填空题
1.样本/组织
2.基因/转录本
3.特异性/敏感性
4.t检验/ANOVA
5.定量/聚类分析
6.归一化/整合
7.分子
三、简答题
1.简述RNA测序(RNA-seq)技术相比传统基因芯片技术的优势。
**解析思路:*要求学生对比两种主流基因表达检测技术,能从检测范围、动态范围、灵敏度、生物学信息量等方面阐述RNA-seq的优势。答案应包含检测所有转录本(非预设探针)、动态范围宽、灵敏度高、能检测新转录本/可变剪接体等。
2.简述在利用基因表达谱进行疾病诊断时,发现和验证生物标志物的一般流程。
**解析思路:*考察对生物标志物发现验证流程的掌握。答案应涵盖:①样本收集与分组;②基因表达谱测序与分析(差异表达筛选);③生物标志物候选基因集的建立;④利用机器学习等方法构建诊断模型;⑤独立验证集的验证(内部/外部验证);⑥模型性能评估(如AUC、灵敏度、特异性);⑦临床转化评估。
3.简述什么是批次效应,并列举至少两种减少批次效应的方法。
**解析思
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