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第30卷第6期草地学报2022年6月
Vol.30No.6ACTAAGRESTIASINICAJun.2022
doi：10.733力.issn.1007-0435.2022.06.014
栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析
孙浩男，李蓉，李明阳，郑妍，刘志杰，张存石，刘冬云*，李鹤*
(河北农业大学园林与旅游学院，河北保定071000)
摘要:为了开发适用于栽培金鸡菊的EST-SSR分子标记，采用二代高通量测序技术对剑叶金鸡菊，斯丹泰勒
(^Coreopsislanceolata*SterntalerO的叶片进行转录组测序。结果表明：通过转录组测序共得到42958条Unigene,
利用MISA软件共检测出个6546个SSR位点,平均分布距离6.36kb。除单核昔酸外，重复类型以二核昔酸和三
核昔酸为主,分别占总数的19.28%和30.13%,二者优势重复单元和占比分别为AG/CTC57.30%)和AAT/ATT
(27.94%)。通过Primer3软件设计得到4499条引，在随机筛选的50对引物中成功开发出22对多态性较好的
引，扩增出的166个条带全部具有多态性。通过UPGMA聚类分析，在遗传距离为0.460时可将100个栽培金
鸡菊种质划分为7类,其遗传相似系数介于0.5422〜1之间，平均为0.7476。金鸡菊组、两色组、歧序组和轮叶组
相关的种质可作为金鸡菊远缘杂交育种的材料。本研究为栽培金鸡菊的分类鉴定、杂交育种和绘制指纹图谱提供
了理论依据。
关键词：金鸡菊;种质资源;EST-SSR；转录组;亲缘关系
中图分类号：S32文献标识码：A文章编号：1007-0435(2022)06-1430-11
DevelopmentofEST-SSRMarkersbasedoTranscriptomeandAnalysis
ofGeneticRelationshipofCultivatedCoreopsis
SUNHao-nan,LIRong,LIMing-yang,ZHENGYan,LIUZhi-jie,ZHANGCun-shi,LIUDong-yun*,LIHe*
(CollegeofLandscapeandTravel,HebeiAgriculturalUniversity,Baoding,HebeiProvince071000,China)
Abstract：TodevelopEST-SSRmolecularmarkersforcultivatedCoreopsis,thetranscriptomeo£theo£Cor
eopsislanceolata6Sterntalerwassequencedbyusinghigh-throughputsequencingtechnology.Basedon
thesequencingdata,weselectedsomepolymorphicprimersforthegeneticrelationshipof100germplasm
resourcesofCoreopsis・Theresultsshowedthatatotalof42958unigeneswereobtainedandatotalof6
546SSRlocisweredetectedbyusingMISAsoftware.Exceptfotmono-nucleotides,t
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