林木外生菌根 GST 基因家族选择压力 PAML 代码+结果+系统发育树试题库及答案.docVIP

林木外生菌根 GST 基因家族选择压力 PAML 代码+结果+系统发育树试题库及答案.doc

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林木外生菌根GST基因家族选择压力PAML代码+结果+系统发育树试题库及答案

一、单项选择题(每题2分,共10题)

1.PAML软件主要用于分析?

A.基因表达B.选择压力C.蛋白结构D.细胞代谢

答案:B

2.构建系统发育树常用的方法不包括?

A.邻接法B.最大似然法C.双倒数法D.贝叶斯法

答案:C

3.GST基因家族功能不涉及?

A.解毒B.信号转导C.光合作用D.抗氧化

答案:C

4.外生菌根对林木的主要作用是?

A.固氮B.增强吸水C.产生激素D.分解有机物

答案:B

5.以下哪种数据不能用于PAML分析选择压力?

A.DNA序列B.氨基酸序列C.蛋白质三维结构D.转录组数据

答案:C

6.系统发育树节点表示?

A.物种B.进化分支C.基因D.时间

答案:B

7.外生菌根真菌与林木形成的关系是?

A.寄生B.共生C.腐生D.竞争

答案:B

8.PAML中用于分析选择压力的模型是?

A.进化模型B.选择模型C.替代模型D.以上都是

答案:D

9.GST基因家族成员之间结构?

A.完全相同B.完全不同C.有相似性D.无规律

答案:C

10.构建系统发育树时序列比对常用工具是?

A.BlastB.ClustalWC.Primer5D.DNAMAN

答案:B

二、多项选择题(每题2分,共10题)

1.外生菌根对林木生长的影响包括?

A.促进养分吸收B.增强抗逆性C.改变土壤结构D.提高光合作用效率

答案:ABC

2.GST基因家族在植物中的功能有?

A.响应逆境B.参与物质运输C.调节生长发育D.合成细胞壁

答案:ABC

3.以下属于PAML软件功能的有?

A.计算选择压力参数B.构建系统发育树C.分析基因表达差异D.预测蛋白结构

答案:AB

4.构建系统发育树的步骤包括?

A.序列获取B.序列比对C.选择建树方法D.评估树的可靠性

答案:ABCD

5.影响GST基因家族进化的因素有?

A.环境压力B.基因复制C.突变D.物种间杂交

答案:ABC

6.外生菌根真菌的特点有?

A.菌丝包裹根尖B.形成菌套C.侵入细胞内D.与林木互利共生

答案:ABD

7.PAML分析选择压力可使用的数据集有?

A.多个物种同源基因序列B.同一物种不同组织基因序列C.不同发育阶段基因序列D.人工合成基因序列

答案:ABC

8.系统发育树的类型有?

A.有根树B.无根树C.二叉树D.多叉树

答案:ABD

9.GST基因家族成员的结构特点可能包含?

A.相似的结构域B.不同的启动子C.相同的内含子数量D.保守的氨基酸基序

答案:ABD

10.研究林木外生菌根GST基因家族选择压力的意义在于?

A.了解基因进化机制B.揭示共生适应性C.为林业育种提供依据D.开发新型农药

答案:ABC

三、判断题(每题2分,共10题)

1.PAML只能分析蛋白质序列的选择压力。(×)

2.系统发育树的分支长度一定代表进化时间。(×)

3.GST基因家族在所有植物中功能完全相同。(×)

4.外生菌根真菌能独立完成所有生命活动,不需要林木。(×)

5.构建系统发育树时序列比对质量不影响结果准确性。(×)

6.PAML分析选择压力不需要设置参数。(×)

7.所有GST基因家族成员结构完全一样。(×)

8.外生菌根可以提高林木对重金属的耐受性。(√)

9.系统发育树的拓扑结构是固定不变的。(×)

10.研究GST基因家族选择压力对理解植物进化没有帮助。(×)

四、简答题(每题5分,共4题)

1.简述PAML分析林木外生菌根GST基因家族选择压力的基本流程。

答案:获取GST基因家族序列,进行序列比对;选择合适的PAML模型,设置参数;运行PAML软件分析,得到如ω值等选择压力参数;根据结果判断基因受选择情况。

2.构建系统发育树的关键步骤有哪些?

答案:首先获取目标序列,接着用合适工具进行序列比对;然后选择建树方法如邻接法等构建初始树;最后通过自展值等方法评估树的可靠性。

3.简述GST基因家族在林木外生菌根中的可能作用。

答案:可能参与外

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