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DSBR:首先是植物靶DNA产生双链断裂,解旋的靶DNA与T-DNA退火;单链部分被核酸内切酶去除;然后进行修复连接,并导致缺失SSGR①在靶DNA上形成一个缺刻,然后由于部分解旋或酶消化形成缺口;②单链T-DNA靠近缺口,由于两链存在短的互补顺序,于是退火形成异质双链;③T链未配对的5’和3’单键部分被除去,T-DNA末端与靶DNA连接;④在靶DNA链的互补链产生缺刻,以游离的3’DNA末端为引物修复合成第二条T-DNA链。修复与复制是T-DNA整合中的重要机理之一。因此T-DNA优先整合进植物染色体转录活跃区,反映了该区的各种拓扑结构如D环、缺刻、缺口、断裂等适合于T-DNA的整合。综上所述,T-DNA的整合是通过植物靶DNA和TDNA间短的同源区段发生重组而完成的,在接口附近伴有DNA顺序的转换和重复。Mxsore等人(2000)的研究证明,组蛋白H2A和T-DNA与植物基因组的整合有关。已知T-DNA可插入多个物理位点,T-DNA可几个拷贝连锁在一起,也可以分别插入不同位点。当多拷贝T-DNA进入同一植物细胞后,这些拷贝之间可能相互作用,导致基因的沉默,这种现象现被称为共抑制(co-suppression)。(1)T-DNA的插入不引起植物DNA大的重排,但多数插入会导致靶位点处小的缺失,缺失多至79个核苷酸。(2)在T-DNA/植物DNA连接处,会有几个至33个核苷酸的“填充”DNA(filerDNA)存在,这些“填充”DNA的序列与靠近连接处的植物DNA序列相似。(3)在植物靶位处不要求有特异的序列,但若在T-DNA两端和植物靶位处之间有一段短序列(5~10bp)同源,则利于整合。(3)T-DNA整合的遗传效应Chv同样参与细菌的附着。ChvA,B,C基因发生突变使根癌农杆菌与植物细胞的滩附率降低10倍。这三个基因与环状a-1,2-葡聚糖的合成和运输有关。ChvB基因产物催化合成葡聚糖;ChvA编码产物则与多糖从胞质转运到胞外有关,pscA位点与环化葡聚糖和琼山酸多聚糖的合成有关。除上述基因外,还有一些染色体基因在T-DNA转移过程中起重要作用。目前巳知农杆菌染色体上有10个基因与T-DNA转移有关。7.3.3、农杆菌染色体基因对T-DNA转移的调控第四节、农杆菌Ti质粒的改造及载体构建(1)目的基因克隆载体:(2)中间克隆载体:中间克隆载体是由大肠杆菌质粒插入T-DNA片段及目的基因、标记基因等构建而成。它是构建中间表达载体的基础质粒。(3)中间表达载体:中间表达载体是含有植物特异启动子的中间载体,其功能是作为构建转化载体的质粒。(4)卸甲载体:卸甲载体是解除武装的Ti质粒或Ri质粒,其功能是作为构建转化载体的受体质粒。(5)植物基因转化载体:植物基因转化载体是最后用于目的基因导入植物细胞的载体,故亦称工程载体。它是由中间表达载体和卸甲载体构建而成。根据它的结构特点又可分为两种转化载体,即一元载体系统和双元载体系统。把载体构建过程称为植物基因工程的上游技术,把转化称为下游工作。野生型Ti质粒直接作为植物基因工程载体存在如下障碍:①Ti质粒分子量过大,比pBR322质粒大50倍左右;②分布着各种限制酶的多个切点;③T-DNA区内含有许多编码基因,其中onc基因的产物干扰宿主植物中内源激素的平衡,使转化细胞长肿瘤,阻碍细胞的分化和植株的再生;④Ti质粒不能在大肠杆菌中复制,即使得到重组质粒,也只能在农杆菌中扩增,而农杆菌的接合转化率极低(10%左右),因此,通过Ti质粒的体外操作,在常规条件下几乎不能构建在T-DNA中只有单一切点的载体;⑤Ti质粒还存在一些对T-DNA转移不起任何作用的基因。
所谓卸甲载体就是无毒的Ti质粒载体。切除T-DNA上的onc基因,即“解除”其“武装”,构建成所谓“卸甲”或称“缴械’载体(disarmedvector)。在这种载体中,已经缺失的T-DNA部位被大肠杆菌的一种常用的质粒pBR322取代。这样任何适合于克隆在pBR322质粒中的外源DNA片段,都可以通过与pBlR322质粒DNA的同源重组,而被共整合到onc-Ti质粒载体上。大肠杆菌能与农杆菌高效率地接合转移。因此,可以先将T-DNA片段克隆到大肠杆菌的质粒中,并插入外源基因,通过接合转移把外源基因引入农杆菌的Ti质粒上。带有重组T-DNA的大肠杆菌质粒衍生载体称为“中间载体”,而接受中间载体的Ti质粒则称为‘受体Ti质粒”(acceptorTiplasmid),一般是卸甲载体(disarmedvector)。onc-卸甲载体7.4.1、卸甲载体对于研究外源基因在转基因植株中的表达,以及对于以改良农作物为目的的植物基因工程而言,p
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