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狂犬病病毒巢式反转录-聚合酶链式反应检测(RT-PCR)
1样品采集、保存及运输
1.1采集部位取待检动物的脑组织。
1.2采集方法对大动物(如犬、猫、牛等)的脑组织标本的采集使用快速采样法,即:用塑料管从头部枕骨大孔或能看见脑组织的位置向眼眶处斜插(或用粗穿刺针从眼角眶向头部枕骨大孔处斜插),然后阻断塑料管尾部与外界大气压强连通,迅速将塑料管拔出。尽量使塑料管通过犬脑的大脑、中脑和小脑部位。取出的塑料管中应有脑组织;将脑组织标本放入无菌离心管中,记录编号后保存备用。
1.3样品保存所有狂犬病标本在2~8℃保存应不超过24小时;在-20℃冰箱冷冻保存应不超过6个月;长期保存时,以-70℃或-80℃冰箱为易。冰冻保存要避免反复冻融,最多冻融3次。
1.4样品运输标本一定要放置在有干冰或冰块的冷藏包中,保持全程冷链运输。要求在运输至实验室时,干冰仍覆盖标本或冰仍未完全融化。
2样品处理
2.1组织样品处理分别从待检脑组织脑干、小脑及海马回三个不同的部位各称取样品约1g,用手术剪剪碎混匀,再取1g于研磨器中研磨,加入1mL生理盐水继续研磨,取100μL匀浆液于1.5mL灭菌离心管中。
2.2阳性对照处理取阳性对照100μL,置1.5mL灭菌离心管中。
2.3阴性对照处理取阴性对照100μL,置1.5mL灭菌离心管中。
3病毒RNA的提取
3.1取已处理的样品、阴性对照和阳性对照,分别加入裂解液600μL,充分颠倒混匀,室温静置3~5min。
3.2将液体吸入吸附柱中(吸附柱要套上收集管,吸取液体时尽量不要吸到悬浮杂质,以免离心时堵塞吸附柱),13000rpm离心30s,弃去收集管中液体,套上收集管。
3.3向吸附柱中加入600μL洗液,13000rpm离心30s,弃去收集管中液体,套上收集管。
3.4重复步骤2.3。
3.5再空柱13000rpm离心2min。
3.6将吸附柱移入新的1.5mL离心管中,在膜中央悬空加入洗脱液50μL,室温静置1min,13000rpm离心30s,获得总RNA。
4扩增操作
4.1RT-PCR扩增设被检样品、阴性对照和阳性对照的份数总和为N,按如下反应体系配制:
RT-PCR反应液22×(N+1)μL
酶混合液3×(N+1)μL
将以上配制的反应体系充分混匀后,分装至每个反应管中各25μL。
分别取5.2.6中已溶解的病毒RNA25μL加入相应反应管中,做好标记。在PCR扩增仪上进行以下反应,反应程序为:50℃30min,95℃3min;扩增条件为95℃40s,56℃45s,72℃90s,35个循环;72℃延伸5min。
4.2PCR扩增将PCR反应液分装至每管中各27μL,每管分别加入22μL无核酸酶水和1μLRT-PCR扩增产物(5.4.1的扩增产物),做好标记。在PCR扩增仪上进行以下反应,反应程序为:95℃3min;扩增条件为95℃40s,56℃45s,72℃30s,35个循环;72℃延伸5min。
5电泳将PCR扩增产物10μL点样于1%琼脂糖凝胶孔中,以110~120V电压于1倍TAE缓冲液中电泳,紫外灯下观察结果。
6结果判定阳性对照出现255bp扩增带、阴性对照无带出现(引物带除外)时,实验结果成立。被检样品出现255bp扩增带为狂犬病病毒阳性,否则为阴性。
【注意事项】
1狂犬病样品的采集应由专业的技术人员完成,以免因样品采集不当而影响实验结果,鉴于待检病料可能含有感染性病毒,要求检验人员必须接受狂犬病暴露前免疫。
2所有用于检测的废弃物品均应放入含消毒液的废物缸内,高压灭菌处理。
3实验室应分配液区、模板提取区和扩增区。工作流程顺序为配液区→模板提取区→扩增区。各区器材试剂专用,不可跨区使用。实验结束后立即用1%次氯酸钠或75%酒精消毒工作台。
4所有试剂应在规定的温度下保存,酶混合液应置于冰盒上使用,其余冷冻保存的试剂使用前应拿到室温融化,再3000rpm离心15s,使液体全部沉于管底。用毕所有试剂立即放回原处。
5在提取RNA时,尽量缩短操作时间,避免RNA酶污染。离心管、吸头等在实验前应全部高压灭菌。用灭菌的镊子夹取离心管,打开和盖上离心管盖时避免手和手套接触离心管口,若离心管开盖时粘在手上或溅出,应立即更换手套;所有接触病料的物品均应合理处理。
6提取的RNA样品,短期内使用放置于2~8℃或冰上,长期应在-70℃保存。
7反应体系在特定配液区或者超净工作台中配制,配制和分装RT-PCR反应液、PCR反应液时应尽量避免产生气泡,上机前检查各反应管是否盖紧。
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