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基于噻二唑结构的组蛋白去乙酰化酶抑制剂的创新设计、合成工艺与生物活性解析
一、引言
1.1研究背景与意义
组蛋白去乙酰化酶(HistoneDeacetylases,HDACs)是广泛存在于真核细胞中的一类金属蛋白酶,在基因表达调控、细胞周期、分化、凋亡等诸多生物过程中发挥着关键作用。HDACs家族各亚型根据结构分为HDACsⅠ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ亚族,其中HDACsⅠ、Ⅱ和Ⅳ亚族属于Zn2?依赖性蛋白酶,HDACsⅢ亚族则需要NAD?发挥作用。它们主要通过催化组蛋白底物和非组蛋白底物的去乙酰化反应,调控基因表达,影响蛋白质的稳定性和结合作用等。
大量研究表明,HDACs各亚型在许多种癌症中过度表达,并且在癌细胞的周期、分化、凋亡、侵袭和转移以及血管生成过程中发挥着重要作用,这充分证明了HDACs与癌症的发生发展密切相关。例如,在乳腺癌细胞系中,HDACs的高表达与癌细胞的增殖和侵袭能力增强相关;在白血病细胞中,HDACs的异常活性影响了细胞的分化和凋亡进程。此外,HDACs的异常还与神经退行性疾病、心血管疾病等多种疾病的发生发展相关。在阿尔茨海默病患者的大脑中,HDACs的活性失调与神经细胞的损伤和凋亡有关;在心肌肥厚的病理过程中,HDACs也参与了心肌细胞的异常增殖和纤维化。
组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HistoneDeacetylaseInhibitors,HDACi)能够有效地抑制癌细胞的增殖,诱导癌细胞分化和凋亡。现有Vorinostat和Romidepsin被FDA批准上市用于治疗皮肤T-细胞淋巴瘤,总计已有22个HDACi进入临床抗癌研究阶段,因此近年来HDACi已成为抗癌新药研发的热点。根据已有HDACs的晶体结构和HDACi的化学结构得出HDACi的药效团模型:Zn2?螯合基团和酶表面识别区域通过连接区域相连接。根据Zn2?螯合基团的不同,可将HDACi分为异羟肟酸类、2-氨基苯胺甲酰类、酰胺类、亲电子酮类、硫醇类、α-巯基酮类、硫脲类、三硫代碳酸酯类和硼酸类等。
2-氨基-1,3,4-噻二唑衍生物具有较好的抗肿瘤活性,同时该结构与近年来报道的HDACi酶表面识别区域具有很好的相似性。本研究基于生物电子等排原理,以2-氨基-1,3,4-噻二唑结构代替异噁唑结构设计新型化合物,期望获得具有更好生物活性的噻二唑类HDACi。这不仅有助于深入理解HDACs的作用机制,还可能为抗癌药物的研发提供新的先导化合物,具有重要的理论意义和潜在的临床应用价值。
1.2国内外研究现状
HDACs的研究始于20世纪90年代,随着对其结构和功能的深入了解,HDACi的研发逐渐成为热点。目前,国内外在HDACs及抑制剂方面取得了诸多进展。
在HDACs的结构与功能研究方面,科学家们已解析了多个HDACs亚型的晶体结构,明确了其催化活性中心及与底物相互作用的关键位点。HDACs通过去乙酰化作用调节染色质结构和基因表达,影响细胞的生理病理过程。不同亚型的HDACs在组织分布和功能上存在差异,HDAC1、HDAC2在多种组织中广泛表达,参与细胞增殖、分化等基本过程;HDAC4、HDAC5主要在心脏、肌肉等组织中发挥作用,与细胞的发育和功能维持相关。
在HDACi的研究领域,异羟肟酸类HDACi是研究最早、最为深入的一类。Vorinostat作为首个上市的HDACi,其在皮肤T-细胞淋巴瘤的治疗中取得了显著疗效。随后,Romidepsin等也相继获批上市。直链异羟肟酸类、N-羟基苯丙烯酰胺类、N-羟基苯甲酰胺类等异羟肟酸衍生物的研究也不断涌现,部分化合物在临床前研究中展现出良好的活性和潜力。2-氨基苯胺甲酰类HDACi以其独特的结构和作用机制受到关注,如Belinostat在临床试验中表现出对某些肿瘤的抑制作用。其他Zn2?螯合基团类HDACi,如酰胺类、亲电子酮类、硫醇类等也在不断探索中,一些化合物在细胞实验和动物模型中显示出一定的HDACs抑制活性和抗肿瘤效果。
在噻二唑类HDACi的设计方面,已有研究基于生物电子等排原理,将噻二唑结构引入HDACi的分子设计中,以改善其活性和选择性。部分研究通过计算机辅助药物设计方法,对噻二唑类HDACi的结构进行优化,预测其与HDACs的结合模式和活性。在合成方面,发展了多种合成路线来制备噻二唑类HDACi及其中间体。常见的方法包括以氨基硫脲与羧酸为原料,通过三氯氧磷等脱水剂进行反应,实现酰卤生成、酰胺缩合和成环反应的一锅法合成;还有利用卤代烃与含噻二唑结构的化合物进行
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