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全科医学临床与教育2025年2月第23卷第2期ClinicalEducationofGeneralPracticeFeb.2025,Vol.23,No.2·105·
·论著·
基于生物信息学方法鉴定抑郁症与帕金森病共同
关键基因
王杰陈聪聪王璐茜
[摘要]目的采用生物信息学方法分析重度抑郁症(MDD)和帕金森病(PD)的基因数据,寻找MDD与PD的共同
关键基因。方法从GEO数据库获取MDD与PD的基因数据集,使用GEO2R进行分析筛选出共同差异基因。通
过基因本体论、京都基因与基因组百科全书数据库进行通路富集分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络探索
MDD与PD的共同关键基因。通过DGIdb数据库寻找候选药物。建立诊断模型并通过ROC曲线评估共同关键基因
的诊断价值。结果本研究发现SNAP25、GABRB1、FSTL5、CADPS、KCNIP1此5个基因可能是MDD与PD的共同关
键基因,且在该两种疾病中均具有良好的诊断价值。针对以上基因,本研究筛选出10个可同步治疗MDD与PD的
候选药物。结论这些共同关键基因的鉴定、共同通路的发现以及候选药物的筛选,为MDD与PD共病的发病机
制、诊断生物标志物和药物治疗提供了新的靶点。
[关键词]抑郁症;帕金森病;差异基因;通路富集分析;生物信息学分析
IdentificationofcommonkeygenesofdepressionandParkinsonsdiseasebasedonbioinformaticsmethods
WANGJie,CHENCongcong,WANGLuxi.EntitledGroupOneWard,TheSeventhPeoplesHospitalofWenzhouCity,
Wenzhou325000,China.
[Abstract]ObjectiveTousebioinformaticsmethodstoanalyzegenedataformajordepressivedisorder(MDD)and
Parkinsonsdisease(PD)andidentifycommonkeygenesbetweenMDDandPD.MethodsGenedatasetsforMDD
andPDwereobtainedfromtheGEOdatabase.CommondifferentiallyexpressedgeneswereidentifiedusingGEO2Ranaly⁃
sis.PathwayenrichmentanalyseswereconductedusingGeneOntology(GO)andtheKyotoEncyclopediaofGenesand
Genomes(KEGG)database.Aprotein-proteininteraction(PP)networkwasconstructedtoexplorethecommonkey
genesbetweenMDDandPD.CandidatedrugswereidentifiedusingtheDGIdbdatabase.Adiagnosticmodelwasestab⁃
lished,andthediagnosticvalueofthecommonkeygeneswasevaluatedusingROCcurves.ResultsWeidentified
5commonkeygenesofMDDandPD:SNAP25,GABRB1,FSTL5,CADPSandKCNIP1.These5geneshavegooddiag⁃
nosticvaluesinthetwodiseases.Basedonthesegenes,wescreenedout10candidatedrugsforsimultaneoustreatmentof
MDDandPD.ConclusionTheidentificationofthesecommonkeygenes,thediscoveryofpossiblesharedpathways
andthescreeningofdrugcandidatesprovidenewtargetsforpathogenesis,diagnosticbiomarkersanddrug
初级会计持证人
专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
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