基于生物信息学方法鉴定抑郁症与帕金森病共同关键基因.pdfVIP

基于生物信息学方法鉴定抑郁症与帕金森病共同关键基因.pdf

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全科医学临床与教育2025年2月第23卷第2期ClinicalEducationofGeneralPracticeFeb.2025,Vol.23,No.2·105·

·论著·

基于生物信息学方法鉴定抑郁症与帕金森病共同

关键基因

王杰陈聪聪王璐茜

[摘要]目的采用生物信息学方法分析重度抑郁症(MDD)和帕金森病(PD)的基因数据,寻找MDD与PD的共同

关键基因。方法从GEO数据库获取MDD与PD的基因数据集,使用GEO2R进行分析筛选出共同差异基因。通

过基因本体论、京都基因与基因组百科全书数据库进行通路富集分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络探索

MDD与PD的共同关键基因。通过DGIdb数据库寻找候选药物。建立诊断模型并通过ROC曲线评估共同关键基因

的诊断价值。结果本研究发现SNAP25、GABRB1、FSTL5、CADPS、KCNIP1此5个基因可能是MDD与PD的共同关

键基因,且在该两种疾病中均具有良好的诊断价值。针对以上基因,本研究筛选出10个可同步治疗MDD与PD的

候选药物。结论这些共同关键基因的鉴定、共同通路的发现以及候选药物的筛选,为MDD与PD共病的发病机

制、诊断生物标志物和药物治疗提供了新的靶点。

[关键词]抑郁症;帕金森病;差异基因;通路富集分析;生物信息学分析

IdentificationofcommonkeygenesofdepressionandParkinsonsdiseasebasedonbioinformaticsmethods

WANGJie,CHENCongcong,WANGLuxi.EntitledGroupOneWard,TheSeventhPeoplesHospitalofWenzhouCity,

Wenzhou325000,China.

[Abstract]ObjectiveTousebioinformaticsmethodstoanalyzegenedataformajordepressivedisorder(MDD)and

Parkinsonsdisease(PD)andidentifycommonkeygenesbetweenMDDandPD.MethodsGenedatasetsforMDD

andPDwereobtainedfromtheGEOdatabase.CommondifferentiallyexpressedgeneswereidentifiedusingGEO2Ranaly⁃

sis.PathwayenrichmentanalyseswereconductedusingGeneOntology(GO)andtheKyotoEncyclopediaofGenesand

Genomes(KEGG)database.Aprotein-proteininteraction(PP)networkwasconstructedtoexplorethecommonkey

genesbetweenMDDandPD.CandidatedrugswereidentifiedusingtheDGIdbdatabase.Adiagnosticmodelwasestab⁃

lished,andthediagnosticvalueofthecommonkeygeneswasevaluatedusingROCcurves.ResultsWeidentified

5commonkeygenesofMDDandPD:SNAP25,GABRB1,FSTL5,CADPSandKCNIP1.These5geneshavegooddiag⁃

nosticvaluesinthetwodiseases.Basedonthesegenes,wescreenedout10candidatedrugsforsimultaneoustreatmentof

MDDandPD.ConclusionTheidentificationofthesecommonkeygenes,thediscoveryofpossiblesharedpathways

andthescreeningofdrugcandidatesprovidenewtargetsforpathogenesis,diagnosticbiomarkersanddrug

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