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③疏水的嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,亲水的磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。大沟和小沟交替出现。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成90°。第62页,共131页,星期日,2025年,2月5日④螺旋横截面的直径约为2nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈)高度为3.4nm。第63页,共131页,星期日,2025年,2月5日示意图ATGC第64页,共131页,星期日,2025年,2月5日⑤两条DNA链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键。碱基的相互结合具有严格的配对规律,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)结合,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)结合,这种配对关系,称为碱基互补。A和T之间形成两个氢键,G与C之间形成三个氢键。在DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。第65页,共131页,星期日,2025年,2月5日第66页,共131页,星期日,2025年,2月5日2.DNA双螺旋的稳定性DNA双螺旋结构在生理条件下是很稳定的。改变介质条件和环境温度,将影响双螺旋的稳定性。第67页,共131页,星期日,2025年,2月5日稳定双螺旋结构的因素①碱基堆积力形成疏水环境,可免受水溶性活性小分子的攻击。即由于双螺旋结构内部形成的疏水区,消除了介质中水分子对碱基之间氢键的影响。(主要因素)。②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,降低了DNA链之间的排斥力、范德华引力等。有助于DNA稳定。第68页,共131页,星期日,2025年,2月5日3.DNA二级结构的多态性A-、B-、Z-DNA的比较相对湿度92%:B—DNA相对湿度75%:A—DNA。双螺旋DNA的结构参数类型旋转方向螺旋直径(nm)螺距(nm)每转碱基对数目碱基对间垂直距离(nm)碱基对与水平面倾角A-DNAB-DNAZ-DNA右右左2.02.31.82.83.44.51110120.2550.340.2720o0o7o第69页,共131页,星期日,2025年,2月5日(1)B型结构(典型的Watson-Crick双螺旋DNA)两条链反向平行,右手双螺旋碱基在内(A=T,G≡C)碱基平面垂直于螺旋轴,戊糖在外每圈螺旋10.4个碱基对螺距:3.32nm2.0nm小沟大沟第70页,共131页,星期日,2025年,2月5日(2)A型结构右手双螺旋,外形粗短。RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子具有这种结构。碱基平面倾斜20o,螺旋变粗变短,螺距2~3nm。(3)Z型结构左手螺旋,外形细长,只有小沟。天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA。第71页,共131页,星期日,2025年,2月5日第72页,共131页,星期日,2025年,2月5日4、?三股螺旋DNAK.Hoogsteen,1963年通常是一条同型寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸-寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟结合。★第一股是寡嘧啶,中间是寡嘌呤,第三股可以是寡嘧啶或寡嘌呤★第三股与寡嘌呤之间同向平行,并按Hoogsteen配对T=A:A,C≡G:C+T=A:TC≡G:G第73页,共131页,星期日,2025年,2月5日★DNA三股螺旋结构常出现在DNA复制、转录、重组的起始位点或调节位点,如启动子区。第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA聚合酶等难以与该区段结合,从而阻遏有关遗传信息的表达。第74页,共131页,星期日,2025年,2月5日第75页,共131页,星期日,2025年,2月5日(三)DNA的三级结构第76页,共131页,星期日,2025年,2月5日第77页,共131页,星期日,2025年,2月5日第78页,共131页,星期日,2025年,2月5日(四)DNA与蛋白质复合物的结构——染色体的结构1、病毒组成:核酸、蛋白、脂类、糖类基因组:单链或双链的DNA(或RNA),多数环状形状:丝状、多面体状2、细菌染色体的结构——(拟核,nucleoid)细菌基因组多数为双链环状DNA,与碱性蛋白、RNA结合,形成带有无数突环的刷状染色体第79页,共131页,星期日,2025年,2月5日第80页,共131页,星期
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