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第三章真菌系统
最近几十年来有关真商系统和进化的研究己发生了很大变化。主要进包括(1)确认
了3界或5界系统是人为的,确认了传统上称作真菌的生物是多元进化的;(2)接受了系统
发育系统学的理论及数据分析技术;(3)分子技术在真菌中的发和应用;(4)另外发现
了新分类单位,包括化石c这些进标志着真菌学令人欢欣鼓舞的时代已经到来。
界K(ingdoms):Whittaker(1969)打破以3界分类系统的传统。这样他承认将所有有生
命的生物分类为原核生物、动物或植物(包括真菌)是不能反映它们的亲缘关系。Whittaker
增加了真菌界母(”口)和原生生物界分(。,公心),他试图将生物放入尽可能反映它们亲绿美系
的各界中。这在试图建立单元进化类群m(onophyleticgroup)(包括祖先及其所有后代的类
群)的努力中是一步重要的开始,并发成为一个命名分类系统,来反映这些类群的亲缘关
系。值得指出的是这种努力并不新,事实上在19世纪就已有其根源H(aeckel,1891;Copeland,
1956).然而,关于成立多少界将所有有生命的和化石的分类单位分类开来的问题还没有解
决L(eedale,1974;Cavalier-Smith,1981,1987;Mohn,1984;Margulis,1990;Corliss,
1990;PattersonSogin,1992)。
在本书中采用的界水平分类反映了本书中包括的生物的假设进化关系。根据进化亲缘关
系进行分类叫作系统发育分类p(hylogeneticclassificatio),分类单位t(axa)s(ing,
taxon),即各组生物的名字,所有分类单位相当于单元进化谱系m(onophyletic
lineage)V(ilgalysHibbett,1993;Bilgalys等,1993)。尽管能在任何标准基础上将生
物区分来,但系统发育的分类方法有助于理解进化变化,使你能根据对其近缘生物的了解对
各种生物作出推测(见Mayr,1982)。在努力确认单元进化类群时,被划入真菌的生物
A(loxopoulosMims,1979;Hawksworth等1983),现在认为应属于3个不同的类群
即单元进化的真菌界、管毛生物界S(tramenopiki)及4个原生动物门B(arr,1992;
Patterson和Sogin,1992;Hawksworth等1994)«该分类系统(图3T)承认这样的事
实被叫作“真菌”的生物并不是密切相关的。然而,Barr(1992)和Brun等(1991)已为真菌
学家们进行的连续研究提出了具有强迫性的原因。我们重申尽管这些生物不拥有一个普通的
进化历史但它们在开矿营养方式及生态上能形成一个紧密交织在一起的类群。
真菌界包括4个门:壶菌门(Chytridiomycotci)第(4章)、接合菌门Z(ygomycot/
(第5章和第6章)、子囊菌门J(scocmycota)(第7-15章)及担子菌门B(asidiomycotQ
(第16-22章)。在共生和衍生特征基础上对这群生物进行分类的可靠证据在后面将进行讨
论。
管毛生物界包括卵菌门O(omyccta)(第23章)、丝壶菌门
H(yphochytriomycota)(第24章)及迷孔粘菌门£(abyr力7力〃/。勿乂?。市)(第25章),认为
它们是某些藻类中独立的谱系B(arr,1992).Patterson1(989)根据鞭毛结构提出了这些生
物是单元进化的新概念引入了“管毛生物”s(tramenopile)的术语。其它4个门认
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