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第45卷第4期渔业科学进展Vol.45,No.4
2024年8月PROGRESSINFISHERYSCIENCESAug.,2024
DOI:10.19663/j.issn2095-9869.20230426001/
吴丹,陈四清,柯翎,张子阳,朱金超,潘鲁莹,李凤辉,徐荣静,彭立成,边力.绿鳍马面鲀雌雄性腺转录组比较分析.
渔业科学进展,2024,45(4):53–64
WUD,CHENSQ,KEL,ZHANGZY,ZHUJC,PANLY,LIFH,XURJ,PENGLC,BANL.Comparativeanalysisofthemale
andfemalegonadaltranscriptomeofThamnaconusseptentrionali.ProgressinFisherySciences,2024,45(4):53–64
绿鳍马面鲀雌雄性腺转录组比较分析*
1,223222
吴丹陈四清柯翎张子阳朱金超潘鲁莹
2452①
李凤辉徐荣静彭立成边力
(1.上海海洋大学水产与生命学院上海201306;2.海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室中国水产科学
研究院黄海水产研究所山东青岛266071;3.福建省农业科学院生物技术研究所福建福州350003;
4.烟台开发区天源水产有限公司山东烟台264001;5.宁德市南海水产科技有限公司福建宁德352102)
摘要为探明绿鳍马面鲀(Thamnaconusseptentrionalis)性腺发育相关基因表达特征,优化亲本生
殖调控技术,本研究对绿鳍马面鲀雌雄亲体的精巢和卵巢进行了转录组测序分析,经denovo拼装,
最终获得119219个单基因(unigene),N50长度为1255bp。在NR、NT、KO、SwissProt、PFAM、
GO及KOG数据库分别注释到24009、35057、18453、26971、30294、11420和21613个unigene。
绿鳍马面鲀精巢和卵巢转录组中存在18954个差异表达基因(DEG),相对于精巢,在卵巢中上调表
达的基因有11265个,下调表达的有7689个。选取bmp2、sox3、figla、hsd17b1、cyp19a、cyp17、
foxl2、star和amh9个DEGs进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,结果显示,qRT-PCR结果与
RNA-Seq分析相一致。GO和KEGG富集结果分析发现,amh、cyp17和star可能在绿鳍马面鲀雄
性精子发生过程中起关键作用;bmp2、foxl2、cyp19a、figla和hsd17b1在雌性卵子发生和卵巢类固
醇生成过程中发挥重要作用。本研究通过比较绿鳍马面鲀精巢和卵巢的转录组表达差异,初步阐明
了精巢和卵巢的基因表达特征,为进一步研究绿鳍马面鲀的性腺发育机制奠定了基础。
关键词绿鳍马面鲀;转录组;性腺;差异表达基因
中图分类号S917.4文献标识码A文章编号2095-9869(2024)04-0053-12
绿鳍马面鲀(Thamnaconusseptentrionalis),隶属于马面鲀网箱养殖的适养周期为每年的5―11月。自然
鲀形目(Tetraodontiformes)、单角鲀科(Monacanthidae)、条件下,黄渤海绿
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