玉米苞叶性状全基因组关联分析.pdfVIP

中国农业科学2025,58(3):431-442

ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2025.03.003

玉米苞叶性状全基因组关联分析

11111111111,2

周广飞，马亮，马璐，张舒钰，章慧敏，宋旭东，张振良，陆虎华，郝德荣，冒宇翔，薛林，

1,2

陈国清

12

江苏沿江地区农业科学研究所，江苏南通226012；江苏省现代作物生产协同创新中心，南京210095

摘要：【目的】苞叶是影响玉米机械直收籽粒的重要性状之一，挖掘与玉米苞叶性状显著关联的遗传位点及候选基因，可为

玉米苞叶性状的遗传改良提供理论依据。【方法】以251份玉米自交系为试验材料，在2个环境下鉴定玉米苞叶数目、长度

和包裹度，借助覆盖全基因组32853个单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphisms，SNP）标记，利用多位SNP

随机效应混合线性模型（multi-locusrandom-SNP-effectmixedlinearmodel，mrMLM）进行全基因组关联分析，检测与

3个苞叶性状显著关联的SNP位点，预测候选基因。【结果】3个苞叶性状在群体中表现出广泛的表型变异，变异系数为10.65%

—40.60%；各性状在基因型、环境及基因型与环境互作均呈极显著差异，广义遗传率均大于80%。利用2个环境的表型数据

及最佳线性无偏预测值，通过全基因组关联分析，共检测到92个与3个玉米苞叶性状显著关联的SNP位点，其中，与苞叶

数目显著关联的SNP位点35个，单个SNP位点可解释1.48%—10.53%的表型变异，与苞叶长度显著关联的SNP位点33个，

单个SNP位点可解释1.61%—21.79%的表型变异，与苞叶包裹度显著关联的SNP位点24个，单个SNP位点可解释2.17%—

20.86%的表型变异。此外，未鉴定到同时与2个性状显著关联的SNP。92个SNP位点中有5个可同时在2个环境和最佳线性

无偏预测值下被检测到，被认为是稳定的SNP位点，与前期研究相比，这5个SNP是新的遗传位点。参考关联群体的连锁不

平衡衰减距离，利用5个稳定SNP位点，结合17个玉米自交系苞叶组织的qRT-PCR分析，筛选到3个玉米苞叶性状候选基

因Zm00001d003850、Zm00001d033706和Zm00001d025612，分别编码BOI相关E3泛素蛋白连接酶、GeBP转录因子和未知功

能蛋白。【结论】检测到92个与3个玉米苞叶性状显著关联的SNP位点，其中5个为稳定位点，预测了3个候选基因可能参

与玉米苞叶性状的形态建成。

关键词：玉米；苞叶性状；全基因组关联分析；优异等位变异；候选基因

Genome-WideAssociationStudyofHuskTraitsinMaize

1111111

ZHOUGuangFei,MALiang,MALu,ZHANGShuYu,ZHANGHuiMin,SONGXuDong,ZHANGZhenLiang,

LUHuHua1111,21,2

,HAODeRong,MAOYuXiang,XUELin,CHENGuoQing

1JiangsuYanjiangInstituteofAgriculturalScience,Nantong226012,Jiangs