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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪个数据库主要用于存储临床意义明确的基因变异信息?
A.dbSNP
B.gnomAD
C.ClinVar
D.ExAC
答案:C
解析:ClinVar(临床变异数据库)专注于收集与疾病相关的变异及其临床意义(如致病性、可能致病性),是临床解读的核心数据库;dbSNP主要存储全物种的单核苷酸多态性(包括良性变异);gnomAD和ExAC(已整合至gnomAD)是群体频率数据库,记录正常人群的变异频率。
根据ACMG变异分类标准,以下哪项属于“致病性”(Pathogenic)的强证据(PS类)?
A.变异在患者中反复检出,且未在健康对照中发现
B.功能实验证实变异破坏基因功能
C.变异位于已知热点突变区域
D.生物信息学工具预测为有害
答案:B
解析:ACMG的PS类(强致病性证据)包括功能实验证实的功能丧失(如PS3);选项A属于中等证据(PM2);选项C属于支持证据(PP3);选项D属于支持证据(PP3/PP4)。
基因测序数据质量控制中,“覆盖度”通常指:
A.目标区域被测序的平均深度
B.目标区域中至少被测序1次的碱基比例
C.测序错误率
D.变异检测的灵敏度
答案:B
解析:覆盖度(Coverage)指目标区域中被测序覆盖的碱基比例(如≥95%的外显子区域被覆盖);平均深度(Depth)是目标区域的平均测序次数;错误率和灵敏度是其他质量指标。
以下哪种变异类型最可能导致基因功能完全丧失?
A.同义突变(Silentmutation)
B.错义突变(Missensemutation)
C.无义突变(Nonsensemutation)
D.内含子剪接位点单碱基变异
答案:C
解析:无义突变会提前产生终止密码子,导致蛋白质截断,通常为功能丧失(LOF)变异;同义突变一般不改变氨基酸;错义突变可能部分影响功能;剪接位点变异可能影响剪接效率,但不一定完全丧失功能。
在解读肿瘤基因检测数据时,重点关注的变异类型不包括:
A.驱动突变(Drivermutation)
B.乘客突变(Passengermutation)
C.药物靶点突变(如EGFRL858R)
D.高频体细胞突变(如TP53)
答案:B
解析:乘客突变是肿瘤发生过程中的随机突变,无功能意义,非解读重点;驱动突变、药物靶点和高频致癌基因突变为关键解读内容。
以下哪项不属于基因数据解读的伦理原则?
A.患者隐私保护
B.结果的临床实用性
C.数据的免费共享
D.知情同意
答案:C
解析:基因数据伦理强调隐私保护(如GDPR)、知情同意(患者需了解检测意义与风险)、结果的临床实用性(避免过度解读);数据共享需在伦理审查和授权下进行,而非“免费共享”。
对于新发变异(Novelvariant),判断其致病性的关键依据是:
A.群体频率数据库中未收录
B.家系共分离分析显示与疾病共分离
C.生物信息学工具预测为有害
D.变异位于基因非编码区
答案:B
解析:家系共分离(即变异在患者中存在、健康亲属中不存在)是新发变异致病性的重要证据(ACMG的PM6/PP1);未收录于数据库(PM2)是中等证据;工具预测(PP3)是支持证据;非编码区变异需结合功能验证。
以下哪种生信分析工具常用于变异注释?
A.GATK
B.ANNOVAR
C.BWA
D.Samtools
答案:B
解析:ANNOVAR是经典的变异注释工具,可添加基因功能、群体频率、致病性预测等信息;GATK用于变异检测(如HaplotypeCaller);BWA用于序列比对;Samtools用于处理SAM/BAM文件。
关于线粒体DNA变异的解读,以下描述错误的是:
A.线粒体变异遵循母系遗传
B.异质性(Heteroplasmy)是关键参数
C.所有线粒体变异均会导致疾病
D.需结合临床表型和功能实验
答案:C
解析:线粒体变异需达到一定异质性水平(如90%)才可能致病,低异质性变异通常无临床意义;母系遗传、异质性分析和表型关联是解读核心。
遗传咨询中,“携带者”通常指:
A.患有显性遗传病的个体
B.携带隐性致病突变但表型正常的个体
C.携带体细胞突变的肿瘤患者
D.携带线粒体变异的男性个体
答案:B
解析:携带者指隐性遗传病中杂合突变(如囊性纤维化)的表型正常个体;显性遗传病患者通常为纯合/杂合致病;体细胞突变不遗传;线粒体变异男性可携带但不传递。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
基因数据解读中,需重点验证的变异类型包括:()
A.新发变异(Denovovariant)
B.家系共分离变异
C.高外显率致病基因的截断变异
D
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