微生物的进化、系统发育和分类鉴定教学材料.pptVIP

第12章微生物的进化、系统发育和分类鉴定;在对大量微生物进行观察、分析和描述的基础上，以形态、结构、生理生化反应和遗传特征的异同为根据，按进化的规律和应用的方便，分门别类的排列成一个系统。;内容提要;序列测定和分析方法：寡核苷酸编目法，全序列分析法。;全序列分析法：采用RT-双脱氧测序及PCR测序，借助计算机进行序列排序。要考虑进化过程中的突变，采用统计学方法校正。

相似系数（距离数据）：统计两序列之间的异同序列数值，来表示微生物之间的进化关系。

印记序列：微生物进化关系的重要特征，包括单碱基印记。;分子系统树：通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树。;系统树中，分枝末端及连结点为结，代表生物类群；末端结代表仍生存的种类；结之间的长度表示分子序列的差异数值。主要采用有根树，有起源及进化方向。

常采用最节省分析法或简约法：进化变化的发生，沿最短的途径，发生最少的变化。;PhylogeneticTreesfromDNASequences;5、三域（界）生物主要特征;目前三域学说已获国界学说界的基本肯定，总体认为，现在一切生物都是由一种共同的远祖进化而来，它原是一种小细胞，先分化出细菌和古生菌这两类原核生物，后来在古生菌分支上的细胞，先、后吞噬了a朊细菌和蓝细菌，并发生了内共生，从而两者进化成与宿主细胞难分难解的细胞器－线粒体和叶绿体，于是，宿主最终也就发展成了各类真核生物。;12.2细菌的分类;等级;群（group，series）：某些微生物特性介于两种微生物之间，不易区分，两个种及它们之间的微生物统称为群。;2、分类单元的命名;（2）第二个字，种名，字首字母小写，微生物的次要性状。;（3）为了防止同物异名或同名异物，有时在种名后附有命名人的姓。如：白孢放线菌应写成ActinomycesalbosporeusKrainsky;3细菌分类与伯杰氏手册;12.3微生物分类鉴定的特征和技术;2血清学试验与噬菌体分型;3氨基酸顺序和蛋白质分析;4核酸的碱基组成和分子杂交;5、遗传重组;对一株未知细菌菌株，如何将其鉴定到种？;微量多项试验鉴定系统：根据微生物生理生化??征的实验结果，进行数码分类鉴定，也称简易诊断技术或数码分类鉴定法；广泛应用于动植物检疫、临床检验、食品卫生、药品检查、环境监测、发酵控制、生态研究等方面。

著名品牌是法国生物—梅里埃集团的API/ATB；ROCHE公司的Micro-ID，Enterotube，Minitek等；美国的Biolog；日本的微孔滤膜块。;主要仪器设备;现代分子生物学和免疫学技术

DNA探针，PCR、DNA芯片、ELISA、免疫荧光、放射免疫及全自动免疫诊断。;12.5微生物资源的保护及开发利用;思考题