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2026年生物信息学算法开发与计算岗招聘试题

一、单选题（共10题，每题2分，合计20分）

考察方向：基础理论、编程语言、算法应用

1.在生物信息学中，用于序列比对的最经典算法是？

A.K-means聚类算法

B.Smith-Waterman算法

C.决策树算法

D.神经网络算法

2.以下哪种编程语言在生物信息学数据处理中最为常用？

A.Java

B.Python

C.C++

D.MATLAB

3.用于基因表达谱聚类分析的常用方法不包括？

A.K-means聚类

B.层次聚类

C.PCA降维

D.贝叶斯分类

4.在生物信息学中，BLAST主要用于？

A.基因组组装

B.序列比对

C.蛋白质结构预测

D.系统发育树构建

5.以下哪个工具不属于常用的RNA-Seq数据分析软件？

A.TopHat

B.HISAT2

C.Samtools

D.GATK

6.生物信息学中，假阳性率（FPR）通常用于评估哪种模型的性能？

A.序列比对

B.机器学习分类器

C.基因预测

D.聚类分析

7.用于基因组组装的常用算法不包括？

A.SPAdes

B.Trinity

C.HMMER

D.MEGAHIT

8.在生物信息学中，BED格式通常用于存储哪种数据？

A.基因表达数据

B.序列比对结果

C.ChIP-seq峰图

D.参考基因组

9.以下哪种方法不属于常用的蛋白质结构预测技术？

A.AlphaFold

B.Rosetta

C.BLAST

D.I-TASSER

10.在生物信息学中，BEDtools主要用于？

A.基因组注释

B.序列比对

C.范围数据处理（如峰图分析）

D.聚类分析

二、多选题（共5题，每题3分，合计15分）

考察方向：综合应用、工具掌握、技术理解

1.以下哪些工具可用于RNA-Seq定量分析？

A.RSEM

B.featureCounts

C.HTSeq-count

D.Kallisto

2.在生物信息学中，常用的序列比对工具包括？

A.BLAST

B.Smith-Waterman

C.Needleman-Wunsch

D.HMMER

3.用于基因组变异检测的常用方法包括？

A.GATK

B.FreeBayes

C.VarScan

D.Samtools

4.以下哪些属于常用的机器学习方法在生物信息学中的应用？

A.支持向量机（SVM）

B.决策树

C.神经网络

D.贝叶斯分类

5.在生物信息学中，常用的基因组注释工具包括？

A.Ensembl

B.NCBIRefSeq

C.Geneious

D.AUGUSTUS

三、简答题（共5题，每题5分，合计25分）

考察方向：概念理解、工具原理、实际操作

1.简述Smith-Waterman算法与Needleman-Wunsch算法的区别及其在生物信息学中的应用场景。

2.解释什么是假阳性率（FPR）和真阳性率（TPR），并说明如何平衡两者以提高生物信息学模型的性能。

3.描述RNA-Seq数据分析的主要流程，并列举至少三个关键步骤及其对应的工具。

4.什么是基因组组装？简述其核心挑战，并举例说明至少两种常用的组装算法。

5.解释什么是ChIP-seq，并说明如何使用BED工具分析ChIP-seq数据。

四、编程题（共2题，每题10分，合计20分）

考察方向：Python编程、生物数据处理、算法实现

1.题目：

编写一个Python函数，实现简单的序列比对（如局部对齐），输入为两条DNA序列（如ATCGTAC和TTGCA），输出为对齐后的序列及得分（设匹配得分为1，不匹配扣1，空位罚分为-2）。

2.题目：

使用Python和pandas库，编写代码读取一个BED文件（包含染色体、起始位置、结束位置三列），统计每个染色体的总覆盖区域长度，并输出结果（格式：染色体名：总长度）。

五、论述题（共1题，15分）

考察方向：综合分析、行业理解、问题解决

题目：

结合当前生物信息学发展趋势（如AI在基因组学中的应用、单细胞测序数据分析等），论述一个你认为最具挑战性的技术问题，并提出可能的解决方案及实现思路。

答案与解析

一、单选题答案与解析

1.B

-Smith-Waterman算法是局部序列比对的经典算法，常用于基因、蛋白质的快速比对。K-means用于聚类，决策树和神经网络属于机器学习。

2.B

-Python因其丰富的库（如Biopython、Pandas）和易用性，在生物信息学中应用最广泛。Java和C++主要用于底层工具开发，MATLAB较少用于大规模数据处理。

3.C