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实验八SDS-聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分离蛋白质;一、目的要求;二、原理
聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺(acrylamide,简称Acr)和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺(N,N—methylene-bisacylamide,简称Bis)在加速剂N,N,N?,N?—四甲基乙二胺(N,N,N?,N?—tetramethylethylenediamine,简称TEMED)和催化剂过硫酸铵(ammoniumpersulfate(NH4)2S2O8,简称AP)或核黄素(ribofavin即vitaminB2,C17H20O6N4)的作用下聚合交联成三维网状结构的凝胶,以此凝胶为支持物的电泳称为聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamidegelelectrophoresis,简称PAGE)。
;凝胶浓度(T)的选择与被分离物质分子量密切相关。
表3.4分子量范围与凝胶浓度的关系
分子量范围 适用的凝胶浓度/(%)
蛋白质
?104 20-30
1-4×104 15-20
1-5×104-1×105 10-15
1×105 5-10
?5×105 2-5
核酸(RNA)
?104 15–20
104–105 5-10
105-2×106 2-2.6
;聚丙烯酰胺凝胶电泳分为连续系统与不连续系统两大类。
目前常用的多为圆盘电泳(如图1)和板状电泳(如图2),两者电泳原理完全相同。
;图1聚丙烯酰胺凝胶圆盘电泳示意图
(A为正面,B为剖面)
(1)样品胶pH6.7(2)浓缩胶pH6.7
(3)分离胶pH8.9(4)电极缓冲液pH8.3
;图2夹心垂直板电泳槽示意图
图3凝胶模示意图
1.样品槽模板2.长玻璃板1.导线接头2.下贮槽3.凹形橡胶框
4.样品槽模板5.固定螺丝6.上贮槽7.冷凝系统;(1)样品浓缩效应
(a)凝胶孔径不连续性:
(b)缓冲体系离子成分及pH值的不连续性;
在pH6.7的凝胶缓冲体系中
前导离子或快离子:HC1解离出的氯根(C1-)
尾随离子(trailingion)或慢离子:甘氨酸根
mcl?clmp?pmG?G(Cl代表氯根,P代表蛋白质,G代表甘氨酸根)有效迁移率=m?,m为迁移率,?为解离度)
当进入pH8.9的分离胶时,甘氨酸解离度增加,其有效迁移率超过蛋白质;
(c)电位梯度的不连续性:
(2)分子筛效应
(3)电荷效应;图5不??续系统浓缩效应示意图
;三、试剂与器材
试剂:10%SDS、凝胶贮液(30%ACr-0.8%Bis)、分离胶缓冲液(3.0mol/LpH8.9Tris-HCl缓冲液)、浓缩胶缓冲液(0.5mol/LpH6.7Tris-HCl缓冲液)、10%过硫酸铵、10%TEMED、pH8.3Tris-Gly电极缓冲液、1%琼脂糖溶液、0.05%考马斯亮兰R250、7%醋酸
器材:垂直板电泳槽、稳压稳流电泳仪、脱色摇床
;五、操作方法
1.安装夹心式垂直板电泳槽
(1)装上贮槽和固定螺丝销钉,仰放在桌面上。
(2)将长、短玻璃板分别插到凵形硅橡框的凹形槽中,注意勿用手接触灌胶面的玻璃。
(3)将已插好玻璃板的凝胶模平放在上贮槽上,短玻璃板应面对上贮槽。
(4)将下贮槽的销孔对准已装好螺丝销钉的上贮槽,双手以对角线的方式旋紧螺丝帽。
(5)竖直电泳槽,在长玻璃板下端与硅胶模框交界的缝隙内加入已融化的1%琼脂(糖)。其目的是封住空隙,凝固后的琼脂(糖)中应避免有气泡。;;3.制备凝胶板
将混合后的分离胶溶液,用细长头的滴管加至长、短玻璃板间的窄缝内,加胶高度距样品模板梳齿下缘约1cm。用1mL注射器在凝胶表面沿短玻璃板边缘轻轻加一层重蒸水(约3–4mm),用于隔绝空气,使胶面平整。约30-60min凝胶完全聚合,则可看到水与凝固的胶面有折射率不同的界线。
将上、下贮槽的蒸
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