质粒构建-protocol优质精品文档.docVIP

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引物设计:

1,选择合适的载体。酶切位点及其顺序(酶切位点的顺序一定不能颠倒)。

2,在NCBI上再次确认目的片段的碱基序列。

首位20个碱基保护碱基4个

首位20个碱基

保护碱基4个

上游酶切位点

设计引物:primer-up:---------

末尾20个碱基的反向互补碱基保护碱基4个下游酶切位点Primer-down:-----------

末尾20个碱基的反向互补碱基

保护碱基4个

下游酶切位点

核对----送公司合成。

对公司合成的引物离心,10000rpm、5-10分钟、at4℃,在超净台按照管子上标注的体积加入高压水(2dH2O),再把上游引物和下游引物混在一起,at4℃保存。

PCR(P出目的片段):

(一)、从韩家淮实验室赠送的菌液里P出目的片段:

1,揺菌过夜:2ul韩家淮实验室的菌液,

15ml离心管Xul相应的抗生素

15ml离心管

3mlLB94℃5min

33cycles2,pcr:菌液1ul94℃30sec

33cycles

Pcr温度体系Pcr(50ul)反应体系2xPFUmix25ul

Pcr温度体系

Pcr(50ul)反应体系

Primer1ul72℃Xmin

2dH2O23ul72℃5min

(X是根据片段的长度设定,500-1000bp/min,退火温度根据Tm值来计算,一般低于Tm值2℃)

3,跑胶、回收:

(1),配胶:

煮沸3次1%的琼脂糖胶:大块称0.6g的琼脂糖

煮沸3次

1%的琼脂糖胶:大块

加入60ml的1XTAE

加入0.6ul的EB(待温度降到50-60℃左右时)

25分钟后,即可点样跑胶。

(2),跑胶:130-150V、25-30分钟左右。

(3),紫外灯下观察,切胶(要带防护手套和口罩)

4,做胶回收(天根{TIANGEN}公司的DNA纯化回收试剂盒):

按照试剂盒的protocol来做,在胶回收的最后一步,ElutionBuffer预先在55-65℃温箱中水浴,并且在加过EB后,放在37℃温箱中2min。

对胶回收的产物跑胶验证。可建立10ul的体系:回收产物2ul、10xloadingbuffer2ul、2dH2O6ul。

酶切、链接:

1,目的片段酶切:(37℃酶切过夜或者4小时)

insert:上述胶回收产物35ul

10xHbuffer(1.5x)7ul

50ul的体系ddH2O6ul

酶11ul

酶21ul

2,载体酶切:(37℃酶切过夜或者4小时)

Vector(1ug/ul):2ul

10xbuffer(1.5x)3ul

20ul的体系ddH2O13ul

酶11ul

酶21ul

为方便以后使用,载体可以一次性多切点。

3,酶切时,首先要核对一下酶的buffer,有时双酶切时两个酶不能共用一种buffer,那么就要先切一端,酶切回收后再用另一酶切另一端,然后再酶切产物回收。

4,连接:

2xRapidLigation6ul

Vector0.8ul

12ul的体系insert4.5ul

(目的是为了多加点insert)T4DNALignase1ul

转化:

质粒10ul感受态细菌10ul{

质粒10ul

感受态细菌10ul

⑴、冰上20分钟-→热激:42℃、90秒-→冰上2分钟

⑵、加1mlSOC(或者1mlLB),37℃、180rpm、45分钟。

⑶、将上述转化后的菌液加入到100ml的LB中。再按抗生素:LB=1:1000的比例加入抗生素,(100ml的LB加50ul的2Kx的氨苄)。

⑷、250

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