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- 2026-01-24 发布于上海
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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种文件格式用于存储带有质量分数的测序原始数据?
A.FASTA
B.FASTQ
C.BAM
D.VCF
答案:B
解析:FASTQ格式包含序列标识符、核酸序列、质量分数标识符和质量分数(用ASCII字符表示),是NGS原始数据的标准格式;FASTA仅包含序列标识符和核酸序列(无质量信息);BAM是压缩后的比对结果文件;VCF用于存储变异信息。
以下哪个工具常用于基因组与参考序列的比对?
A.BWA
B.GATK
C.FastQC
D.Trinity
答案:A
解析:BWA(Burrows-WheelerAligner)是经典的短序列比对工具;GATK主要用于变异检测和质控;FastQC用于原始数据质量控制;Trinity是转录组组装工具。
下列哪项不是RNA-seq差异表达分析的常用统计方法?
A.DESeq2
B.edgeR
C.limma-voom
D.PLINK
答案:D
解析:DESeq2、edgeR和limma-voom均为RNA-seq差异表达分析的主流工具(前两者基于负二项分布,后者适用于标准化后的数据);PLINK是全基因组关联分析(GWAS)的工具。
人类基因组中,外显子占比约为?
A.1%
B.10%
C.50%
D.80%
答案:A
解析:人类基因组中外显子(编码蛋白质的区域)仅占约1%,其余大部分为非编码区(如内含子、调控区、重复序列等)。
三代测序(如PacBio)的主要优势是?
A.测序成本低
B.读长更长
C.错误率更低
D.通量更高
答案:B
解析:三代测序(单分子实时测序)的核心优势是读长可达数万碱基(远超二代测序的100-300bp),但错误率较高(约15%),成本和通量低于二代测序。
GO(基因本体论)不包含以下哪个分类?
A.分子功能(MolecularFunction)
B.细胞组分(CellularComponent)
C.生物过程(BiologicalProcess)
D.代谢通路(MetabolicPathway)
答案:D
解析:GO分为分子功能、细胞组分、生物过程三大类;代谢通路属于KEGG(京都基因与基因组百科全书)的分类范畴。
以下哪个数据库主要存储蛋白质相互作用信息?
A.GenBank
B.Ensembl
C.STRING
D.dbSNP
答案:C
解析:STRING数据库专注于蛋白质-蛋白质相互作用网络;GenBank存储核酸序列;Ensembl提供基因组注释;dbSNP存储单核苷酸多态性(SNP)信息。
用于评估基因组组装质量的关键指标是?
A.Q30
B.N50
C.GC含量
D.比对率
答案:B
解析:N50是组装连续性的核心指标(所有contig按长度排序后,累计长度达总长度50%时的最短contig长度);Q30是测序数据质量指标;GC含量反映序列组成;比对率是测序数据与参考基因组的匹配比例。
以下哪种变异类型不属于结构变异(SV)?
A.插入(Insertion)
B.单核苷酸变异(SNV)
C.倒位(Inversion)
D.缺失(Deletion)
答案:B
解析:结构变异通常指长度≥50bp的基因组变异(如插入、缺失、倒位、易位等);单核苷酸变异(SNV)是单个碱基的改变,属于小变异(SmallVariant)。
单细胞测序(scRNA-seq)的关键技术是?
A.目标区域捕获
B.单细胞分离与扩增
C.长读长测序
D.全基因组重测序
答案:B
解析:scRNA-seq需先通过微流控或流式细胞术分离单个细胞,再进行mRNA捕获和扩增(如Smart-seq2技术),否则无法区分不同细胞的表达谱。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)(每题至少2个正确选项)
以下属于二代测序(NGS)技术的有?
A.IlluminaHiSeq
B.PacBioSequel
C.OxfordNanoporeMinION
D.IonTorrentProton
答案:AD
解析:Illumina(边合成边测序)和IonTorrent(半导体测序)属于二代测序(短读长、高通量);PacBio(单分子实时测序)和OxfordNanopore(纳米孔测序)属于三代测序(长读长)。
基因组注释的主要内容包括?
A.基因定位(基因在哪里)
B.基因功能预测(基因有什么作用)
C.非编码RNA识别
D.变异频率统计
答案:ABC
解析:基因组注释的核心是识别基因和其他功能元件的位置与功能(如编码基因、非编码RNA、启动子等);变异频率统计属于群体遗传学分析,不属于注释范畴。
以
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