鸡Fnip1基因克隆、组织表达及生物信息学分析.pdfVIP

江苏农业学报(ＪｉａｎｇｓｕＪ.ｏｆＡｇｒ.Ｓｃｉ.)ꎬ２０２５ꎬ４１(１):１１９￣１２５

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黄正洋ꎬ孔令琳ꎬ王钱保ꎬ等.鸡Ｆｎｉｐ１基因克隆、组织表达及生物信息学分析[Ｊ].江苏农业学报ꎬ２０２５ꎬ４１(１):１１９￣１２５.

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１０００￣４４４０.２０２５.０１.０１４

鸡Ｆｎｉｐ１基因克隆、组织表达及生物信息学分析

黄正洋ꎬ孔令琳ꎬ王钱保ꎬ李春苗ꎬ吴兆林ꎬ黄华云ꎬ赵振华

(江苏省家禽科学研究所ꎬ江苏扬州２２５１２５)

摘要:为了明确鸡卵泡素相互作用蛋白１基因(Ｆｎｉｐ１)特征及其表达规律ꎬ本研究选择苏禽３号黄羽肉鸡为

试验材料ꎬ运用分子克隆技术扩增了鸡Ｆｎｉｐ１基因ＣＤＳ区序列全长ꎬ对其序列特性进行了生物信息学分析ꎬ构建了

系统进化树ꎻ利用ＲＴ￣ｑＰＣＲ方法检测了Ｆｎｉｐ１基因在鸡不同组织中的表达ꎮ结果获得鸡Ｆｎｉｐ１基因ＣＤＳ区ꎬ序列

开放阅读框为３４７４ｂｐꎬ位于第１３号染色体１６１９１４１５ｂｐｐ之间ꎬ编码１１５７个氨基酸ꎮ生物信息学

分析结果显示ꎬＦｎｉｐ１基因有２０个外显子ꎬＦＮＩＰ１蛋白含有ＦＮＩＰ＿Ｎ、ＦＮＩＰ＿Ｍ和ＦＮＩＰ＿Ｃ等３个结构域ꎻ进化树显

示ꎬ鸡先与鸟类聚为一类ꎬ再与哺乳动物聚为一支ꎬ在禽类上序列保守ꎮＦＮＩＰ１蛋白为亲水性蛋白ꎬ相对分子量为

１２８３１０ꎬ理论等电点为５２５ꎮ蛋白质二级结构由α￣螺旋(３４４０％)、β￣折叠(４.０６％)、延伸链(１３７４％)、无规则卷

曲(４７８０％)组成ꎮ表达分析结果显示ꎬＦｎｉｐ１基因在鸡的胸肌和腿肌中表达量显著高于其他组织ꎮ综上所述ꎬ本

研究获得了鸡Ｆｎｉｐ１基因ＣＤＳ区序列全长ꎬ发现其在鸡肌肉组织中有较高表达ꎮ本研究结果可为进一步研究

Ｆｎｉｐ１基因在鸡肌肉生长发育中的分子机制研究奠定数据支撑ꎮ

关键词:鸡ꎻＦｎｉｐ１ꎻ基因克隆ꎻ表达分析ꎻ生物信息学分析

中图分类号:Ｓ８３１.２文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣４４４０(２０２５)０１￣０１１９￣０７

ＣｌｏｎｉｎｇꎬｔｉｓｓｕｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆｃｈｉｃｋｅｎＦｎｉｐ１ｇｅｎｅ

ＨＵＡＮＧＺｈｅｎｇｙａｎｇꎬＫＯＮＧＬｉｎｇｌｉｎꎬＷＡＮＧＱｉａｎｂａｏꎬＬＩＣｈｕｎｍｉａｏꎬＷＵＺｈａｏｌｉｎꎬＨＵＡＮＧＨｕａｙｕｎꎬ

ＺＨＡＯＺｈｅｎｈｕａ

(ＪｉａｎｇｓｕＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＰｏｕｌｔｒｙＳｃｉｅｎｃｅꎬＹａｎｇｚｈｏｕ２２５１２５ꎬＣｈｉｎａ)

Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｔｏｃｌａｒｉｆｙｔｈｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓａｎｄｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐａｔｔｅｒｎｓｏｆｃｈｉｃｋｅｎｆｏｌｌｉｓｔａｔｉｎ￣ｉｎｔｅｒａｃｔｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ１ｇｅｎｅ(Ｆｎｉｐ１)ꎬ

ＳｕｑｉｎＮｏ３ｙｅｌｌｏｗ￣ｆｅａｔｈｅｒｅｄｂｒｏｉｌｅｒｓｗｅｒｅｓｅｌｅｃｔｅｄａｓｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌｍａｔｅｒｉａｌｓｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙꎬａｎｄｔｈｅｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆｃｈｉｃｋ￣

ｅｎＦｎｉｐ１ｇｅｎｅＣＤＳｒｅｇｉｏｎｗａｓａｍｐｌｉｆｉｅｄｂｙｍｏｌｅｃｕｌａｒｃｌｏｎｉｎｇｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙＭｏｒｅｏｖｅｒꎬｔｈｅｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆｉｔｓｓｅｑｕｅｎｃｅ

ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｗａｓｃａｒｒｉｅｄｏｕｔꎬａｎｄｔｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｗａｓｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄＴｈｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｏｆＦｎｉｐ１ｇｅｎｅｉｎｄｉｆｆｅｒｅｎｔｔｉｓｓｕｅｓｏｆ

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ｉｎｇｆｒａｍｅｏｆｔｈｅｓｅｑｕｅｎ