表观遗传学演示文稿.pptVIP

南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系表观遗传学演示文稿第一页，共14页。优选表观遗传学第二页，共14页。一、DNA甲基化 DNA甲基化(DNAmethylation)是研究得最清楚、也是最重要的表观遗传修饰形式，主要是基因组DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基间的共价结合，在空间上阻碍转录因子复合物与DNA的结合。DNA甲基化一般与基因沉默相关联；非甲基化一般与基因活化相关联；而去甲基化往往与一个沉默基因的重新激活相关联。第三页，共14页。二、组蛋白修饰 组蛋白（histones）真核生物体细胞染色质中的碱性蛋白质，根据氨基酸成分和分子量不同，主要分成5类H1、H2A、H2B、H3、H4，由4种组蛋白H2A、H2B、H3和H4，每一种组蛋白各二个分子，形成一个组蛋白八聚体，约200bp的DNA分子盘绕在组蛋白八聚体构成的核心结构外面，形成了一个核小体。连接相邻2个核小体的DNA分子上结合了另一种组蛋白H1染色质就是由一连串的核小体所组成。第四页，共14页。二、组蛋白修饰第五页，共14页。二、组蛋白修饰组蛋白修饰是表观遗传研究的重要内容。组蛋白的N端是不稳定的、无一定组织的亚单位，其延伸至核小体以外，会受到不同的化学修饰，这种修饰往往与基因的表达调控密切相关。被组蛋白覆盖的基因如果要表达，首先要改变组蛋白的修饰状态，使其与DNA的结合由紧变松，这样靶基因才能与转录复合物相互作用。因此，组蛋白是重要的染色体结构维持单元和基因表达的负控制因子。第六页，共14页。二、组蛋白修饰活化修饰：乙酰化，赖氨酸甲基化，丝氨酸磷酸化(Ac-K9,4H3/Me3-K4H3/P-S10H3)抑制修饰：赖氨酸甲基化(Me3-K9K3)第七页，共14页。二、组蛋白修饰组蛋白修饰种类乙酰化--一般与活化的染色质构型相关联，乙酰化修饰大多发生在H3、H4的Lys残基上。甲基化--发生在H3、H4的Lys和Asp残基上，可以与基因抑制有关，也可以与基因的激活相关，这往往取决于被修饰的位置和程度。磷酸化--发生与Ser残基，一般与基因活化相关泛素化--一般是C端Lys修饰，启动基因表达。SUMO（一种类泛素蛋白）化--可稳定异染色质。其他修饰第八页，共14页。三、染色质重塑染色质修饰与重塑（共价修饰型与ATP依赖型）第九页，共14页。三、染色质重塑（A）结合（B）松链（C）重塑八聚体转移八聚体滑动+ATP重塑复合物ATP依赖的染色质重构机制染色质重塑复合物依靠水解ATP提供能量来完成染色质结构的改变，根据水解ATP的亚基不同，可将复合物分为SWI/SNF复合物、ISW复合物等，这些复合物及相关蛋白均与转录激活和抑制、DNA甲基化、DNA修复及细胞周期相关。第十页，共14页。四、RNA调控RNA干扰（RNAi）作用是生物体内的一种通过双链RNA分子在mRNA水平上诱导特异性序列基因沉默的过程。由于RNAi发生在转录后水平，所以又称为转录后基因沉默（post-transcriptionalgenesilencing,PTGS）。RNA干扰是一种重要而普遍表观遗传的现象。第十一页，共14页。五、其他表观遗传机制除DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、和RNA调控以外，还有遗传印迹、X染色体失活、等。遗传印迹、X染色体失活的本质仍为DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑。第十二页，共14页。一、概述染色质免疫沉淀技术(chromatinimmunoprecipitationassay,CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。应用：第十三页，共14页。二、原理检测目标基因活性在保持组蛋白和DNA联合的同时，染色质被切成很小的片断，通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体，将目标片段（组蛋白发生特异标记的片段）沉淀下来。从而检测那些基因的组蛋白发生了修饰。第十四页，共14页。南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学系