结核分枝杆菌Rv3203蛋白的生物信息学及免疫信息学分析.pdfVIP

第37卷第21期医学信息Vol.37No.21

2024年11月JournalofMedicalInformationNov.2024论著

窑论著窑

结核分枝杆菌Rv3203蛋白的生物信息学

及免疫信息学分析

余海燕袁任芹袁孟余袁李光华袁杨国平

渊大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室袁云南大理671000冤

摘要院目的运用生物信息学及免疫信息学方法分析结核分枝杆菌渊Mtb冤Rv3203蛋白的结构特征袁为研究Rv3203蛋白在Mtb

感染中的功能提供基础遥方法利用信息学软件分别预测Rv3203蛋白的理化性质尧溶解度尧跨膜区尧信号肽尧亚细胞定位尧糖基

化位点尧磷酸化位点尧相互作用蛋白尧免疫原性尧抗原性尧毒性尧致敏性袁以及T尧B细胞抗原表位和二级结构袁并对蛋白的三级结

构进行建模袁最后对Rv3203蛋白进行密码子优化尧计算机克隆和构建进化树遥结果Rv3203蛋白由224个氨基酸组成袁理论等

电点为4.68袁为结构稳定的弱疏水性蛋白曰无跨膜区和信号肽袁定位于细胞质袁具有1个糖基化位点和11个磷酸化位点曰与

lipD尧lipE尧lipP尧lipZ尧amiB2尧amiC尧bpoC尧Rv0183尧Rv1367c和Rv3204发生相互作用袁参与Mtb的多种生物学过程曰免疫原性为

3.4211袁抗原性为0.6533袁无毒性袁无致敏性曰含5个CTL表位尧1个Th表位和4个B细胞表位曰二级结构和三级模型含大量的

琢-螺旋和无规则卷曲曰经密码子优化后可在大肠杆菌中克隆并高效表达曰此外袁Mtb的Rv3203蛋白还与

具有高度同源性遥结论Rv3203蛋白是一个结构稳定且具有热稳定性的酸性蛋白袁具有免疫原性和抗

原性袁无毒性和致敏性袁含多个T/B细胞表位袁可在体外克隆并高效表达袁参与Mtb的多种生物学过程及调控宿主的免疫应答

反应遥

关键词院结核分枝杆菌曰Rv3203曰生物信息学曰免疫信息学

中图分类号院R378.911文献标识码院ADOI院10.3969/j.issn.1006-1959.2024.21.005

文章编号院1006-1959渊2024冤21-0023-07

BioinformaticsandImmunoinformaticsAnalysisofRv3203Protein

YUHaiyan,RENQin,MENGYu,LIGuanghua,YANGGuoping

(DepartmentofMedicalMicrobiologyandImmunology,CollegeofBasicMedicalSciences,DaliUniversity,Dali671000,Yunnan,China)

Abstract：ObjectiveToanalyzethestructuralcharacteristicsof(Mtb)Rv3203proteinbybioinformaticsand

immunoinformaticsmethods,andtoprovideabasisforstudyingthefunctionofRv3203proteininMtbinfection.MethodsThephysicochemical

properties,solubility,transmembraneregion,signalpeptide,subcellularlocalization,glycosylationsite,phosphorylationsite,interactingprotein,

immunogenicity,antigenicity,toxicity,alle