肝细粒棘球蚴病病灶毗邻及远端肝组织非编码RNA表达谱分析.pdfVIP

152中国血吸虫病防杂志（中英文）2025年第37卷第2期ChinJSchistoNo.2

文章编号：1005-6661(2025)02-0152-11·论著·

D0I:10.16250/j.32.1915.2024216

肝细粒棘球蝴病病灶毗邻及远端肝组织

非编码RNA表达谱分析

艾尔夏提·依布拉音1.2,艾则麦提·艾克拜尔12,吾布力卡斯木·米吉提1.3徐祺林²，

阿布都西库尔·阿布都米吉提²,吴源泉²，卡哈尔·吐尔逊1,2*

[摘要]目的采用全转录组测序技术分析肝细粒棘球坳病(cysticechinococcosis,CE)病灶毗邻组织与远端正常组织

的非编码RNA(non-codingRNA，ncRNA)差异表达，并对差异表达ncRNA进行功能注释，以探讨ncRNA在CE发病中的

潜在作用。方法收集肝CE患者术中毗邻病变组织及远端正常肝组织样本，利用全转录组测序技术检测微小RNA（mi-

croRNA，miRNA）、环状RNA（circularRNA，circRNA）、长链ncRNA（longncRNA，lncRNA）表达谱，筛选差异表达基因，并

进行基因本体论（GeneOntology，GO)和京都基因与基因组百科全书(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)功

能注释分析。同时，借助Cytoscape软件构建circRNA/lncRNA-miRNA-信使RNA（messengerRNA，mRNA)竞争性内源

RNA（competitiveendogenousRNA，ceRNA）网络，并通过实时荧光定量PCR

PCR,RT-qPCR)验证该网络中的关键miRNA。结果在肝CE病灶毗邻组织与远端正常组织间共检测到41个差异表达

miRNA，其中8个上调miRNA、33个下调miRNA，主要富集于Ras信号传导和中性粒细胞活化等生物学过程；检测到5个

差异表达circRNA，其中3个上调circRNA、2个下调circRNA，主要富集于激素信号通路及RNA转录调控功能；检测到

447个差异表达lncRNA，其中200个上调lncRNA、247个下调lncRNA，涉及细胞增殖、免疫调节及细胞外基质重塑等通

路。miRNA靶向分析发现，hsa-miR-27a-5p、hsa-miR-21-3p和hsa-miR-181b-2-3p为ceRNA网络中的关键节点。RT-qPCR

验证结果显示，以CE病灶远端组织中上述基因相对表达量为1,CE病灶毗邻组织中ENSG00000253736、HAS2-AS1、PC-

SK6、hsa-miR-21-3p、hsa-miR-27a-5p、MIR23AHG、VIPR1-AS1、LINC02910、hsa-miR-181b-2-3p的相对表达量分别为3.00±

0.25

因相对表达量差异均有统计学意义（t=6.21、5.83、7.51、7.46、6.12、6.65、7.13、1.87、7.81,P均0.01），以上结果与测序结

果一致。结论肝CE病灶毗邻及远端组织中差异表达的ncRNA可能通过调控细胞增殖、免疫逃逸和炎症反应参与CE

发病,hsa-miR-27a-5p和hsa-miR-21-3p可能是关键miRNA。

【关键词】细粒棘球病；肝脏；全转录组测序；非编码RNA；微小RNA;环状RNA；长链非编码RNA；竞争性内源RNA

网络

[中图分类号]R532.32[文献标识码]

1A

Non-codingRNAsexpressionprofileofadjacentanddistantlivertissuesof

hepaticcysticechinococcosislesions

IRSHATIbrahim,AIZEMAITIAikebaier2,WUBULIKASIMU