基于组学数据的桑树水淹响应MYB基因挖掘与分析.pdfVIP

摘要

桑科植物作为我国重要的经济作物之一，在农业生产中占据着举足轻重的地位。

然而，在部分地区的夏秋季节，频繁的降雨与较差的排水条件常常导致积水现象发生，

这一现象对桑树的正常生长产生了显著的负面影响，最终导致产量显著下降。因此，

深入研究水淹胁迫对桑树的伤害机制及其适应机制，鉴定耐涝关键基因，对于桑树的

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优质高产栽培及育种改良具有重要的理论和实际意义。本研究以桑树品种育为试

验材料，对其进行了0d、1d、3d和7d的水淹处理，并进行了转录组分析和MYB基

因家族鉴定与表达分析，最终筛选出响应水淹胁迫的关键基因MnMYB10。以桑树

cDNA为模板，通过PCR技术成功克隆出MnMYB10基因全长序列，构建植物过表达

载体，利用农杆菌浸染法，对拟南芥进行遗传转化，经抗性筛选及鉴定，得到阳性拟

南芥植株。通过对转基因拟南芥进行水淹处理，对MnMYB10基因的功能进行了初步

验证。主要研究结论如下：

以水淹处理0d、1d、3d和7d后的桑树叶片为材料构建了12个文库，转录组测

序共产生了540,843,510个原始reads，筛选出25692个差异表达基因（Differentially

ExpressedGenes,DEGs0d1d3d7d16283

）。其中，水淹、、和四个时期分别筛选出、

16367、15589和15692个差异基因。KEGG富集分析表明，水淹胁迫诱导的DEGs

主要富集在类黄酮合成、玉米素合成、淀粉和蔗糖代谢、MAPK信号通路和苯丙素

ROSRBOHAPXGSTU

合成等途径。水淹处理后，相关基因、和在桑树中显著上调，

ERF和ABA8ox4等参与激素信号转导的基因以及bZIP、NAC、MYB和WRKY等转

录因子基因在水淹胁迫下也呈现显著差异表达。

MYB113MnMYB

桑树基因家族全基因组鉴定与分析结果表明，桑树个基因可

进一步分为八个亚族。桑树MYB家族蛋白均为亲水性蛋白质，都含有SANT结构域

和低复杂性结构域。对筛选出来的关键基因MnMYB10进行序列分析，结果显示其

CDS长度为1500bp。通过农杆菌介导法，将过表达MnMYB10载体转入拟南芥中，

成功获得转基因拟南芥。对野生型（WT）和过表达MnMYB10拟南芥植株水淹处理

5d后，我们发现转基因和野生型拟南芥叶片部分变成透明色，且都出现变黄的现象。

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恢复培养天后，转基因拟南芥叶片复绿，且正常生长发育，而野生型拟南芥部分植

株死亡，并延迟抽薹，生长发育严重受到抑制。该现象表明过表达MnMYB10转基因

植株提高了其耐涝性。生理生化指标分析结果表明，水淹胁迫使转基因植物体内SOD、

POD活性显著升高，而野生型植株则呈现下降趋势。在水淹胁迫下，野生型和转基

I

因叶片中MDA含量均迅速升高。此外，转基因拟南芥的可溶性蛋白含量在水淹情况

下表现较为稳定，而野生型则表现出相反的趋势。这些结果表明，MnMYB10基因可

能通过调控植株的各项生理指标，降低水淹胁迫对细胞膜的损害程度，从而增强植株

对水淹胁迫的抗性。

关键词：桑树水淹胁迫转录组MYB转录因子

II

Abstract

AsoneoftheimportantcashcropsinChina,mulberryplantsoccupyapivotal

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