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- 2026-02-14 发布于河南
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评价荧光定量PCR仪,用这些指标
荧光定量PCR的检测是一系列从采样、保存运输、样品处理、核
酸提取、扩增等一系列流程的组合,任何一个环节出现问题都会导致
最终结果的错误。虽然在前面一系列的文章中讲述了提取试剂、扩增
试剂的评价但是这些仍远远不够,因此我在后续的文章中会尽可能覆
盖到所有的检测环节。
荧光定量PCR的检测离不开荧光定量PCR试剂和荧光定量PCR
仪器。试剂的评价可以参考(诊断试剂评价系列2-核酸检测方法(更
正))。但是每次提到荧光定量PCR仪的评价,大家总是望而却步。
一方面原因是荧光定量PCR仪涉及很多温度、光电信号需要专业
的设备来评估,另一方面也确实不知道从哪里入手。今天我们梳理下
在核酸检测实验室中如何通过试验来评价荧光定量PCR仪。
荧光定量PCR仪的物理性能试验相关指标
通过物理方法测定PCR性能的试验。主要包括测定温度和荧光来
进行评价,由于需要专业的设备,建议联系计量部门或仪器厂家进行
相关指标的测定。
1.最大升温速率:50℃-90℃应不小于2.5℃/秒。
2.
3.平均升温速率:50℃-90℃应不小于1.5℃/秒。
4.最大降温速率:90℃-50℃应不小于2.0℃/秒。
5.平均降温速率:90℃-50℃应不小于1.5℃/秒。
6.模块控温精度:应不大于0.5℃。
7.温度准确度:测定值与设定值应不超过±0.5℃。
8.模块温度均匀性:温度差值在±1℃范围内。
9.温度持续时间准确度:温度持续时间与设定温度时间偏差在±5%
以内。
10.热盖温度偏差:温度差值在±3℃范围内。
11.荧光强度检测重复性:高中低浓度校准染料重复测定的变异
系数不大于3%。
12.荧光强度检测精密度随机选取10个及以上个检测孔,用高
中低浓度校准染料进行检测,变异系数不大于5%。
13.不同通道荧光干扰其他通道荧光检测强度不高于目标通道荧
光阈值。
14.
荧光定量PCR仪的生物化学试验相关指标
对温度敏感的PCR反应对PCR仪进行生化性能试验。该指标可以
通过荧光定量PCR的试验对仪器进行评价,每个核酸检测实验室都可
以开展的评价试验。
1.样本检测重复性对高中低浓度核酸样品进行检测,Ct值变异系
数不大于3%。
2.
3.样本线性对系列稀释梯度浓度的样品(至少5个梯度)进行检
测,回归系数R不低于0.99。
4.
5.荧光线性对系列稀释荧光染料(至少5个梯度)进行检测,回
归系数R不低于0.99。
荧光定量PCR仪评价的试验设计
1.试验准备
1.1有证标准物质
国内外有证标准物质,标准物质类型为质粒DNA或RNA。不推
荐使用自制没有进行定量的质控品。
1.2荧光染料
可以选用试剂盒自带的ROX染料或购买标准荧光染料。
1.3.荧光定量PCR方法
需要使用经过验证过的荧光定量方法:扩增效率90%-110%(越
接近100%越好);R2大于0.99;最低检测限应低于10copies/反
应。
1.4.反应体系
质量高口碑好的反应体系。
1.5.耗材
仪器推荐使用的专用于荧光定量PCR的耗材。
1.6.荧光定量PCR反应条件
常规荧光定量PCR反应条件,普通模式,40个循环。不建议使用
快速模式和预扩增反应条件。
2.重复性试验
选择高中低浓度标准物质进行检测(推荐浓度为5000copies/反
应、500copies/反应和50copies/反应),每个浓度至少5次重复,
样品管随机放置在反应板中心和边缘的不同位置。Ct值变异系数不大
于3%。
样品放置的位置尽可能分散,也可以如下图。
3.样本线性试验
对已知浓度的样品进行5倍
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