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[]Gaussian的Link、IOp与非计算路径

2010-03-0922:07

Gaussian的Link、IOp与非计算路径

文/Sobereva2010-MAR-9

1.Gaussian程序的基本结构

是由很多功能不同的独立可执行程序组成的，它们被称为Link，在它们之间通

过临时文件来传递数据，最主要的是rwf文件，每个Link的功能在手册里都

有简单介绍。Link间的调用顺序实际上是随意的，但是只有某些固定顺序的调用

（还包括循环、分支、跳转方式的调用）才有意义，才能完成特定的任务。每个

Link对应的可执行文件名的通式为Iyyxx.exe，例如L314对应的可执行程序B14.exe

就是yy=3、xx=14。yy代表的是这个Link所属的overlay，也称为层，功能相近的

子程序被归在一层，如overlay6主要是分析波函数，所以包括了L601（布层数和

相关的分析）、L607（NBO分析）、L609（AIM分析）等子程序。同一层的Link

也经常连在一起被调用，如L301、L302、L303、L311、L314它们总是连在一起调

用来完成基组的设定和电子积分。

L0、L1、L9999相对其它Link较为特殊，它们并不用来执行实际的计算，而且不论

何种任务，它们都一定会执行。

L0：在程序最开始执行，用来初始化运行环境。与L0对应的程序并不叫L0.exe，

若在03中，dos版本它就对应g03.exe，windowsGUI版本就是g03W.exe，

unix版本就对应g03。L0会创建L1进程，然后在全部Link调用结束前会一直保持

睡眠状态。L0还会把输入文件成一份”输入文件”到用户设的scratch目录

中，其名字在windows版本下就是gxx.inp，在unix版本下为”进程id号.inp”，任务

正常结束后会被自动删掉，其内容相对于输入文件没有了注释行（开头为!的行），

并且用@来的外部文件会在其中被展开。

L1：被Link0所调用。用来初始化临时文件、解析输入文件中routesection段落的

、生成调用以后Link所需令行指令。L1和L0共同组成overlay0。

L9999：最后一个被调用的Link，进行任务的扫尾工作。它确保最重要的信息已写

入chk，输出第程序所需的文件（如.wfn波函数文件），生成条目（是指

在格言之前输出的那段计算数据的紧凑描述），输出古怪的格言，最后结束整个任

务。

2.选项(IOp,InternalOption)

每个Link都有其IOp，各个选项的选项值决定了这个Link如何运行，每个IOp的解

释可以在查到，遇见个别查不到的，需用《察看Gaussian全部IOP

的方法》

（）文中

的方法。

在routesection段落所指定的计算任务和方法被L1所解析后，哪些Link会被调用，

并且以什么参数来调用就确定了。例如#H

F/STO-3G会被解析成下面这样，称为非路径（不同版本解析出的结果可

能有些不同）：

1/38=1/1;

2/17=6,18=5,40=1/2;

3/6=3,11=9,16=1,25=1,30=1/1,2,3;

4//1;

5/5=2,32=1,38=5/2;

6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;

99/5=1,9=1/99;

上面每行内容格式是