畜禽养殖场高铜抗性沙门菌的全基因组特征及铜抗性基因的遗传环境分析.pdfVIP

生态毒理学报第20卷第6期2025年12月

AsianJournalofEcotoxicologyVol.20,No.6Dec.2025

DOI:10.7524/AJE.1673-5897.20250512001CSTR:32064.14.AJE.1673-5897.20250512001

邹柯依,GhulamRazaMUSTAFA,付静霞,等.畜禽养殖场高铜抗性沙门菌的全基因组特征及铜抗性基因的遗传环境分析[J].生态毒理学报,

2025,20(6):288-300.

ZOUKY,MUSTAFAGR,FUJX,etal.GenomiccharacteristicsofhighcopperresistantSalmonellainlivestockfarmsandanalysisofthegeneticenvi-

ronmentofcopperresistancegenes[J].Asianjournalofecotoxicology,2025,20(6):288-300.

畜禽养殖场高铜抗性沙门菌的全基因组特征及铜抗性

基因的遗传环境分析

111211,#1,*

邹柯依,GhulamRazaMUSTAFA,付静霞,韩新锋,赵珂,戢林,邹立扣

1.四川农业大学资源学院,成都611130

2.四川农业大学动物医学院,成都611130

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收稿日期2025-05-12录用日期2025-06-18

摘要:铜作为一种在畜牧业中广泛应用的抗菌剂,其大量使用致使环境中铜浓度急剧升高,可能通过诱导细菌产生适应性进

化,推动抗生素耐药基因(antibioticresistancegenes,ARGs)与毒力基因(virulencefactors,VFs)的共选择与水平基因转移(horizon-

talgenetransfer,HGT)。然而,目前对于高铜耐受菌株中,铜抗性基因与ARGs、VFs的相关性及其促进沙门菌适应性进化的分

子机制仍不完全明确。为此,本研究对从零售肉类和家禽养殖环境中分离的9株高铜抗性沙门菌,铜的最小抑菌浓度(mini-

-1

muminhibitoryconcentration,MIC)为1600mg·L,进行全基因组测序分析。多位点序列分型(multilocussequencetyping,

MLST)结果显示,9株沙门菌分为5个ST型,以ST34、ST19为主;通过基因组分析,这些菌株携带丰富的ARGs(112个)、VFs

(146~205个)以及重金属抗性基因(heavymetalresistancegene,HMRGs,94个);相关性分析发现,铜抗性基因cueO、cusS、

pcoABCDERS与β-内酰胺类耐药基因和四环素类耐药基因以及黏附、分泌系统相关毒力基因存在显著正相关性(相关性系数

r0.6);进一步对铜抗性基因环境分析显示,铜抗性基因与VFs中fimAICDHFZYW、可移动遗传元件(mobilegeneticelements,

MGEs)中tnsABCD、traC-traI以及β-内酰胺类耐药基因LRA-3、四环素类耐药基因tet(D)共存,有助于高铜抗性沙门菌在环境

中传播。本研究揭示了高铜抗性沙门菌中铜抗性基因与ARGs的共选择机制,强调了铜抗性基因在促进抗性传播中的潜在作

用,为防控畜禽养殖业中重金属胁迫下的抗性传播提供了理论依据。

关键词:畜禽养殖;高铜抗性沙门菌;全基因组分析;铜抗性基因;遗传环境

文章编号:1673-5897(2025)6-288-13中图分类号:X171.5文献标识码:A

GenomicCharacteristicsofHighCopperResistantSalmonellainLivestock

FarmsandAnalysisoftheGeneticEnv