圆十一刺栗壳蟹线粒体基因组全序列测定及玉蟹科系统发育分析.pdfVIP

第44卷第1期浙江海洋大学学报(自然科学版)Vo1.44No.1

2025年1月浙江海洋大学学报(自然科学版)第44卷

JournalofZhejiangOceanUniversity(NaturalScience)Jan.,2025

文章编号:2096－4730(2025)01－0020－09

圆十一刺栗壳蟹线粒体基因组全序列测定及玉蟹科

系统发育分析

汪凯欣，张楠楠，吴文超，吕文拯，杨翼菲，龚理

(浙江海洋大学海洋科学与技术学院，海洋生物种质资源发掘利用国家地方联合工程研究中心，浙江舟山316022)

摘要：以圆十一刺栗壳蟹为对象，通过高通量测序首次组装了线粒体基因组全序列，其全长为15713bp，共编码37

个基因，以及1段长984bp的非编码控制区；总碱基组成具有明显的AT偏向性(71.0%)。所有蛋白质编码基因的起始密码子

均为ATN，终止密码子则包括TAA及不完全终止密码子T。与其他后生动物一样，除了tRNA-Ser1缺失二氢尿嘧啶臂(DHU

臂)，其他tRNA均能形成典型的三叶草结构。为了厘定玉蟹科的进化地位，研究基于最大似然法和贝叶斯法构建了短尾次目

系统发育树，2种方法均显示玉蟹科与黎明蟹科形成姐妹群关系后再与馒头蟹科聚为一支，支持玉蟹科与黎明蟹科共享更近

的亲缘关系。此外，系统发育树也支持了扇蟹科及馒头蟹总科、酋妇蟹总科、方蟹总科和沙蟹总科的非单系性。研究结果不仅

丰富了玉蟹科线粒体基因组全序列，为玉蟹科分类及系统发育提供了更多分子数据，同时为更好地理解短尾次目起源演化

奠定了理论基础。

关键词：短尾次目；玉蟹科；线粒体基因组；非单系；系统进化

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中图分类号：Q959.223.63文献标识码：A

TheCompleteMitochondrialGenomeofArcanianovemspinosa

(Branchyura:Leucosiideae)andItsPhylogeneticImplications

WANGKaixin,ZHANGNannan,WUWenchao,etal

(SchoolofMarineScienceandTechnologyofZhejiangOceanUniversity,NationalandProvincialJoint

EngineeringResearchCentreforMarineGermplasmResourcesExplorationandUtilizationofZhejiangOcean

University,Zhoushan316022,China)

Abstract:ThisstudyfocusesonArcanianovemspinosaastheresearchobjectandassemblesitscomplete

mitochondrialgenomesequenceforthefirsttimeusinghigh-throughputsequencing.The15713bp-long

mitogenomeencodestheentiresetof37genesandacontrolregionof984bp.Thegenomebasecomposition

showsanobviousATbias