泡桐卷野螟(草螟科:斑野螟亚科)线粒体全基因组测序与分析.pdfVIP

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  • 2026-03-17 发布于江西
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泡桐卷野螟(草螟科:斑野螟亚科)线粒体全基因组测序与分析.pdf

南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2024,55(5):1355-1365

ISSN2095-1191;CODENNNXAAB

DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2024.05.011

泡桐卷野螟(草螟科:斑野螟亚科)线粒体

全基因组测序与分析

**

汪瑞涵,雷子逸,匡明珠,刘豫,王宇,荣华

(江西农业大学生物科学与工程学院,江西南昌330045)

摘要:【目的】明确泡桐卷野螟[Pycnarmoncribrata(Fabricius,1794)]的线粒体基因组结构特征,分析其系统发育

关系,为揭示泡桐卷野螟的分类地位及进化关系研究提供分子依据。【方法】利用IlluminaNova6000高通量测序平台

测定泡桐卷野螟的线粒体基因组,对基因组序列进行注释和分析;基于草螟科8个亚科21种昆虫及2种夜蛾总科昆虫

的线粒体蛋白编码基因(Protein-codinggenes,PCGs),采用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育进化树。【结果】泡桐

卷野螟线粒体基因组为双链闭合环状结构,全长15125bp,共编码37个基因(13个PCGs、22个tRNA基因和2个rRNA基

因)和1个A+T富含区,共有14个基因间隔区,10个基因重叠区。泡桐卷野螟线粒体全基因组序列中AT碱基的含量为

81.1%,表现出明显的AT偏好性。13个PCGs中除cox1基因以TTG为起始密码子外,其余均以ATN作为起始密码子;除

cox1和cox2基因以不完全密码子T作为终止密码子外,其余均以TAA结尾。在tRNA二级结构中,trnS1基因缺少DHU

臂和DHU环,trnT基因缺少TφC环,并存在U-U和G-U碱基错配现象。系统发育分析结果显示,斑野螟亚科的所有物

种聚在同一分支,支持该亚科的单系性;泡桐卷野螟与卷野螟属的乳翅卷野螟(P.lactiferalis)和豹纹卷野螟(P.pan‐

therata)聚为一个分支,构成姐妹群关系。【结论】获得了泡桐卷野螟的线粒体全基因组序列,其线粒体基因组符合草

螟科线粒体基因组的一般特征。

关键词:泡桐卷野螟;线粒体全基因组;全序列测定;系统发育分析

中图分类号:S433.4文献标志码:A文章编号:2095-1191(2024)05-1355-11

Sequencingandanalysisofthecompletemitochondrialgenome

ofPycnarmoncribrata(Fabricius,1794)(Crambidae:

Spilomelinae)

**

WANGRui-han,LEIZi-yi,KUANGMing-zhu,LIUYu,WANGYu,RONGHua

(CollegeofBioscienceandEngineering,JiangxiAgriculturalUniversity,Nanchang,Jiangxi330045,China)

Abstract:【Objective】ThestudyaimedtodeterminethemitochondrialgenomestructurecharacteristicsofPycnarmon

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