表达谱芯片验证探针选择与PCR引物设计原则.pdfVIP

表达谱芯片验证探针选择的注意事项

尊敬的客户：

首先十分感谢您选择了上海伯豪作为您的芯片服务商，我们一直

致力于向客户提供稳定、可靠的数据，为客户的科研工作保驾护航。

当您拿到芯片数据后，下一步的工作内容将是对芯片的数据结果

进行验证。而验证的工作可以分为以下的四个步骤：

1.利用RT-qPCR等方法，在相同的样本内对芯片本身的数据质量

进行评估；

2.利用PCA或聚类分析等方法，对实验设计中的样本分组质量进

行评估；

3.根据文献报道或已有知识判断芯片数据中找到的差异基因是

否符合预期；

4.扩大样本量，检验在新的个体或处理中，差异基因是否依然存

在。

而在以上的几步验证过程中，第一步的验证要注意的事项却往往

被忽略而出现问题。为了让您能够准确有效地选取合适的探针，我们

在下文中列举了表达谱芯片的验证中涉及到的探针筛选和引物设计

的原则及注意事项供您参考。此外还通过一个真实案例的分析，加深

理解，希望让您在后续的实验及研究中少走弯路。

靶基因（探针）的选择及PCR验证引物设计原则：

1.选出的目的探针的荧光原始信号值应该较高。

首先应该排除Flag为A的