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- 2026-04-17 发布于江苏
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内容;分子动力学----简介;;基本原理;Verlet法(最常见)
如果将粒子的位置按泰勒级数展开:
如果将式子中的δt换为-δt,则上式变为:
将上面两式相加得到:
;如果两式相减,则可得到:
即可以由t+δt和t-δt的位置得到t时刻的速度.
缺点:此式含有1/δt,因为δt很小,因此非常容易导致误差,为了矫正这个缺点,Verlet又发展出了Leapfrog法(跳蛙法)。;Leapfrog法;分子动力学----牛顿运动方程的数值解法;预测矫正法GearPredictor-Corrector;预测矫正法;分子动力学----牛顿运动方程的数值解法;分子动力学----积分步长的选取;例1;分子动力学----积分步长的选取;分子动力学----简化单位;例如:氩(39.5)的熔点为84K,ε=0.24kcal/mol,σ=3.504?,系统的密度为1.784g/cm3,设计算时的步长10-12s,压力1atm,则各物理量可以简化为:;如果系统中含有不止一种原子,则选取其中一种原子的LJ参数作为简化单位的标准,例如水分子中有H和O两种原子,可以选取O的LJ参数进行简化。;分子动力学----分子动力计算流程;分子动力学----分子动力计算流程;执行分子动力学计算时,将一定数目的分子放在一定形状的盒子中,并使它的密度和实验密度相符合,再选定
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