空间转录组蛋白质组技术.ppt

数据分析与可视化08空间基因表达图谱构建数据标准化处理对原始表达矩阵进行归一化和对数变换，消除批次效应和技术偏差，确保不同空间点之间的表达量可比性。常用方法包括CPM、TPM标准化以及log1p转换。高变基因筛选通过计算基因表达变异系数，筛选出空间表达模式显著的高变基因，通常选择前50-100个变异度最高的基因用于热力图构建，突出组织区域特异性表达特征。层次聚类分析对基因和空间点进行双向层次聚类，通过树状图展示共表达基因模块与空间邻近关系，识别功能相关的基因簇及其对应的组织功能区。多重免疫荧光成像采用循环免疫荧光技术（如CODEX、MIBI）对组织切片中数十种蛋白质标记物进