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宏基因组分析的技术框架

目录

一、技术框架概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．2

二、样本处理层技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

三、数据标准化层处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

数据格式标准化处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

质量控制(序列清洗)．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

连接酶测序法数据校准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

测序深度校正计算．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

数据归档与版本管理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

四、序列分析技术维度．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

基因装配算法选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

参考基因组比对技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

非参考环境序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．