同源蛋白质建模准确性评估策略.pptx

同源模建评价方法

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评价方法

立体化学

RMSD

PROSA程序评价

Verify3D

碳骨架二面角

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立体化学

PROCHECK:对于模型中残基与残基之间的立体化学性质作出评价,用Ramachandran图表示。

ERRAT:评价原子间非键相互作用的整体性质。

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非键合原子之间的最小接触距离

键合原子:肽链上彼此用共价键连接的原子.

非键合原子:肽链上彼此不用共价键连接的原子.

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非键合原子之间的最小接触距离

α-碳原子的二面角旋转时,会带动其它原子和相应的基团一

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