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基于图神经网络的药物耐药性预测结题报告

一、研究背景与问题提出

在全球公共卫生领域，细菌、病毒等病原体的耐药性问题正逐渐成为威胁人类健康的重大挑战。据世界卫生组织（WHO）统计，每年全球约有70万人死于耐药性感染，若不采取有效措施，到2050年这一数字可能攀升至1000万，超过癌症的致死人数。耐药性的产生，本质上是病原体在药物选择压力下发生基因突变或获得外源耐药基因的结果，这使得原本有效的治疗药物逐渐失效，导致治疗方案复杂化、医疗成本上升，甚至引发无药可医的“超级细菌”危机。

传统的药物耐药性预测方法主要基于实验测定和统计分析。实验测定方法通过体外培养病原体并测试其对不同药物的敏感性，虽然结果准确，但存在周期长、成本高、通量低的缺点，难以应对病原体快速变异的现实需求。统计分析方法则通过收集大量临床数据，挖掘病原体特征与耐药性之间的关联，然而这类方法往往依赖于人工提取的特征，无法充分捕捉病原体基因组和蛋白质组中的复杂结构信息，预测精度受限。

随着高通量测序技术的发展，病原体的基因组、转录组和蛋白质组数据呈爆炸式增长。如何从这些海量的生物数据中高效挖掘与耐药性相关的信息，成为耐药性预测领域的关键问题。图神经网络（GraphNeuralNetworks,GNNs）作为一种能够处理图结构数据的深度学习模型，为解决这一问题提供了新的思路。生物系统天然具有图结构特征，例如基因调控网络、蛋