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基于图注意力的药物致癌性预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物研发是一个高投入、高风险、长周期的复杂过程，其中药物安全性评价是决定药物能否成功上市的关键环节。致癌性作为药物安全性的核心指标之一，直接关系到患者的长期用药安全。传统的药物致癌性评价主要依赖于动物实验，然而这种方法存在诸多局限性：一方面，动物实验周期长，通常需要2-3年才能获得结果，极大地延长了药物研发周期；另一方面，动物与人类在生理结构、代谢途径等方面存在显著差异，导致动物实验结果向人类的外推性较差，可能出现假阳性或假阴性结果。此外，动物实验还面临着伦理争议和高昂的成本问题，据统计，仅一项完整的药物致癌性动物实验成本就高达数百万美元。

随着计算机技术和人工智能的快速发展，基于计算模型的药物致癌性预测方法逐渐成为研究热点。这类方法通过对药物的化学结构、理化性质、生物活性等数据进行分析，构建预测模型，能够在药物研发早期快速、低成本地评估药物的致癌风险，为药物筛选和优化提供重要参考。然而，现有的计算模型大多基于传统的机器学习算法，如支持向量机、随机森林等，这些方法在处理药物分子的复杂结构信息时存在不足。药物分子是一种典型的图结构数据，原子作为节点，化学键作为边，传统的机器学习算法难以有效捕捉分子图中的局部和全局结构信息，导致预测性能受限。

图注意力网络（GraphAttentionNetwork,GAT）作为一种新