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基因测序行业空间转录组技术应用调研报告

一、空间转录组技术的核心原理与技术迭代

空间转录组技术是在单细胞转录组技术基础上发展而来的革命性技术，它突破了传统转录组测序丢失细胞空间位置信息的瓶颈，实现了在组织切片上同时获取细胞基因表达数据和空间位置信息。其核心原理是通过特定的技术手段，将组织切片中的RNA分子与带有空间位置标记的探针结合，在完成测序后，根据探针的位置信息将基因表达数据映射回组织的原始空间位置，从而构建出组织的空间基因表达图谱。

（一）第一代空间转录组技术：基于微阵列的捕获技术

2016年，瑞典皇家理工学院的研究团队开发出第一代空间转录组技术，该技术依赖于带有位置条形码的微阵列芯片。在实验过程中，先将新鲜冷冻的组织切片放置在微阵列芯片上，组织切片中的RNA分子会与芯片上的探针结合，这些探针带有独特的位置条形码。随后，对结合的RNA进行反转录、扩增和测序，通过解码位置条形码，就能确定每个RNA分子在组织切片中的原始位置。不过，第一代技术的空间分辨率相对较低，大约在100-200微米，这意味着一个捕获点可能包含多个细胞，无法实现真正的单细胞级别的空间转录组分析。

（二）第二代空间转录组技术：提升分辨率与通量

为了克服第一代技术的局限性，第二代空间转录组技术应运而生。其中，10xGenomics公司推出的Visium平台是第二代技术的代表。Visium平台将微阵列芯片的捕获点