绿色棉纤维类黄酮3袁5羟基化酶基因的克隆及实时定量表达分析.pdfVIP

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棉花 学 报 Cotton Science 2010 22 渊5冤院403~408 色棉纤维类黄酮3 5 羟基化酶基因 的克隆及实时定量表达分析 1 1 1 2 1* 新惠 李艳军 张新宇 王红娟 孙 杰 1. 河子大学农学院/ 新疆兵团绿洲生态农业重点实验室袁新疆石河子832003 曰2. 河子大学生命科学学院袁 新疆 河子832003 冤 摘要院 以发育18 d 的天然绿色棉及其近等基因系白色棉纤维细胞为材料袁利用cDNA-AFLP 结合cDNA 末端 快速扩增技术袁克隆了1 个绿色棉纤维优势表达基因的全长cDNA 遥 序列分析结果表明袁该cDNA 全长1873 bp 袁含有一个编码509 个氨基酸残基的开放阅读框遥 Blast 分析表明袁该基因的编码产物为一个类黄酮3 袁5 羟 基化酶袁 该基因命名为 袁序列提交到GenBank 袁登录号为GU062 184遥 实时荧光定量PCR 检测结果 显示院 在绿色棉不同组织中的表达量均显著高于其近等基因系白色棉袁而且主要在纤维细胞中表达遥 在纤维发育过程中袁 在纤维发育的早期表达量最高袁并随纤维发育逐渐降低遥推测该基因可能在绿色 棉纤维色素前体物质的形成中发挥作用遥 关键词院棉花曰绿絮曰类黄酮3 袁5 羟基化酶曰实时定量PCR 中图分类号院S562.035 文献标识码院A 文章编号院1002-7807 渊20 10冤05-0403-06 1 1 1 2 1* TIAN Xin-hui , LI Yan-jun , ZHANG Xin-yu , WANG Hong-juan , SUN Jie 渊1. g 832003, ; 2. 832003, 冤 cDNA-amplified fragment length polymorphism渊cDNA-AFLP 冤was employed to analyze genes that are specifically or preferentially expressed in color cotton fiber cells. Using rapid amplification of cDNA ends(RACE), the complete cDNA se- quence of gene was isolated from green cotton fiber at the 18 day post anthesis (DPA). The full-length of this cDNA clone was 1873 bp, and its largest open reading frame encoded 509 amino acids. The gene was designated as (Gen- Bank accession: GU062184). Fluorescence real time quantitative PCR method were used to study the expression of gene in different development stages. Real-time PCR analysis showed that specially expressed in naturally green cot- ton f

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