中国对虾微卫星引物筛选及反应条件优化.pdfVIP

中国对虾微卫星引物筛选及反应条件优化.pdf

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维普资讯 第 27卷 第 1期 海 洋 水 产 研 究 Vo1.27,No.1 2 O O 6 年 2月 MARINEFISHERIESRESEARCH Feb.,2006 中国对虾微卫星引物筛选及反应条件优化 孟宪红 孔 杰 刘 萍 高 焕 (中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛 266071) (中国科学研究院海洋研究所,青岛 266071) 摘要 对 33对 中国对虾 ( P,.0 “P“5chinensis)微卫星 引物进行筛选,确定 了其 中 ll对 引物 的最优 PCR反应条件 ,包括各对 引物的退火温度、反应体系中引物、Mg。、dNTPs含量等,为建立微 卫星多重 PCR技术、最终使微卫星标记成为中国对虾家系识别的有效工具奠定了基础。 关键词 中国对虾 (FP彻 0声PⅡP“chinensis) 微卫星DNA 家系识别 引物 聚合酶链式反应 中图分类号 Q7;Q959.223 .63 文献识别码 A 文章编号 1000—7075(2006)O10035—05 SSR primerscreeningandoptimization 0fF ,.Dp n chinensis MENG XianHong KONGJie LIU Ping GAO Huan。 ( Yellow SeaFisheriesResearchInstitute,ChineseAcademyofFisherySciences,Qingdao266071) (。InstituteofOceanology,TheChineseAcademyofSciences,Qingdao266071) ABSTRACT Theoptimizedreactionsystem,includingtheannealingtemperature,theprim— ers,andtheconcentrationofMg anddNTPs,etc.,of11pairsofprimersweredeterminedby screening33pairsofSSRprimersofFP,2,2Pr0户P,2以Pz£schinensis.Theresultmaylayafoundation forestablishing theSSR MultiplePCR technique,whichwillprobabllybecometheefficient methodofthefamilies’identificationofFP,2Pr0户P,2口e“schinensisinthefuture. KEY WORDS FP,2,2Pr0 P,2以Pz£schinensis M icrosatelliteDNA Families’identification Primer PolymeraseChainReaction (PCR) 微卫星DNA (MicrosatelliteDNA)又称单一的序列重复(SimpleSequenceRepeat,SSR),由1~6个碱基 对的核心序列串联重复而成,其位点数 目巨大并随机分布于整个基因组中,具有丰富的长度多态性信息且按孟 德尔方式遗传,近年来越来越广泛的应用于遗传连锁图谱的构建、种质鉴定、家系分析以及遗传疾病的诊断等 (Aliaheta1. 1999;McConnelleta1. 1995),为分子生物学研究热点之一 中国对虾(FP P,.0声鲫n “chinensis)是我国海水养殖重要经济种类 。由于 1993年我国发生 中国对虾暴 发性流行病,致使育苗、养殖的成活率和效益

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