基于代谢组学的芽胞杆菌三个属胞外代谢物异质性研究.docVIP

基于代谢组学的芽胞杆菌个属胞外代谢物性研究 (福建省农业科学院农业生物资源研究所，福建 福州 350003) 摘要：气相色谱质谱联用（GC/MS）方法了芽胞杆菌并对结果做了PCA和聚类分析，结果表明供试不同属的芽胞杆代谢物种类和含量不同有所不同，而同属的菌株代谢物相似，同属的菌株能聚成一类。其中类芽胞杆菌属和芽胞杆菌属又聚为一个亚类，而短芽胞杆菌属聚为另一个亚类。 关键词：芽胞杆菌，CHEN Zheng, LIU Bo*, SHI Huai, ZHU Yu-jing，LIU Guo-Hong，(Institute of Agrobiological Resources, Fujian Academy of Agricultural Sicences, Fuzhou, Fujian 350003, China) Abstract： metabolites were indentified from these genera. The result of PCA and hierarchical cluster analysis show that the metabonomics in different generic were different. The metabonomics in the same generic were similar. The strains of the same genera could be clustered into one group. The strains of Paenibacillus and Bacillus clustered into one subgroup, and stains of Brevibacillus clustered into one subgroup. Three metabolic markers were identified from the metabolites of three Bacillus genera. Key words: Bacillus，metabonomics，genera，extracellular metabolites，heterogeneity 芽胞杆菌属Bacillus是一类产芽孢的革兰氏阳性细菌，产生具有抗逆性球形或椭圆形芽孢，芽孢对高温、紫外、干燥、电离辐射和很多有毒化学物质都有很强的抗性。在工业领域用于环境污染治理等在农业领域用于生物农药等医学领域用于新型药物载体等芽胞杆菌的代谢物研究有过许多报道，如对芽胞杆菌挥发性物质的研究，包括枯草芽胞杆菌E20 、BL02、G8、短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX挥发性物质的研究等；对芽胞杆菌发酵液成分研究，包括多粘类芽胞杆菌HY96-2；多粘类芽胞杆菌BS04；枯草芽胞杆菌B36；枯草芽胞杆菌BY-2；短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX等；芽胞杆菌脂肪酸成分的研究，包括需氧芽胞杆菌芽胞脂肪酸分析。然而，对该短短芽胞杆菌的代谢物差异的研究未见报道。 1 材料与方法 1.1 材料 供试菌株7株，均为DSMZ标准菌种，分别为：莫海威芽胞杆菌FJAT-10005（Bacillus mojavensis）；植物内芽胞杆菌FJAT-10010（Bacillus endophyticus）；蜂房类芽胞杆菌FJAT-10002（Paenibacillus alvei）；解凝乳类芽胞杆菌FJAT-10009（Paenibacillus curdlanolyticus）；波茨坦短芽胞杆菌FJAT-10006（Brevibacillus borstelensis）；桥石短芽胞杆菌FJAT-10008（Brevibacillus choshinensis）；美丽短芽胞杆菌FJAT-10011（Brevibacillus formosus）。 保鲜菌种子培养基：淀粉 1.0 %，牛肉膏 0.5 %，蛋白胨 0.3 %，蔗糖 1.0 %，酵母粉 0.5 %，CaCl2 0.5 %，pH 7.0。发酵培养基：TSB培养基（美国BD公司）。实验试剂：分析纯丙酮。实验仪器：主要实验仪器采用美国Agilent公司制造的7890A/5975C气质联用仪（GC/MS）；电子天平（Navigator NO4120）；恒温摇床（HZQ-F160）；pH计。 1.2 实验方法 1.2方法 1.2.1样品制备方法 各取200 mL 芽胞杆菌菌株发酵液于1 L三角瓶中，加入200 mL丙酮溶液，充分搅拌后，隔8 h搅拌一次，24 h后，离心取上清液A。对离心后的残余部分，加入等体积的丙酮，萃取24h后离心得上清液B，与原来的萃取液A合并。最后取部分溶液加无水硫酸钠处理，离心取上清液加入GC小瓶