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昆虫学报Acta Entomologica Sinica ,January 20 12 ,55 (1) 1 - 11 ISSN 0454 -6296
基于Solexa 高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究
# # *
, , ,
贺华良 宾淑英 吴仲真 林进添
( , 510225)
仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所 广州
: Phyllotreta striolata (Fabricius) 。 ,
摘要 黄曲条跳甲 是十字花科蔬菜的重要害虫 为深入了解其遗传信息 本研究应
Illumina ’s Solexa , SOAPdenovo
用新一代高通量测序技术 平台对黄曲条跳甲成虫的转录组进行测序 并结合 拼接聚
, EST 。 4 924 (contig), 2 209
类等分析软件 获取大量的 和挖掘功能基因 本文最终获得了 条序列重叠群 其中包含
Drosop hila melanogaster (unigene) 610
种与黑腹果蝇 蛋白基因具直系同源的独立基因 和 种黄曲条跳甲物种特有的
unigene 。 Gene Ontology (GO) , unigene (binding capability)
结合 数据库进行分析 发现大部分的 具结合能力 和催化
(catalytic activity); unigene 、
活性 上百种 可聚类于生物学过程分类中的配子发生 生殖腺发育和交配行为等重要功
。 , KEGG Pathway , 363 unigene 40 ,
能 另外 结合 数据库分析发现 共有 种 参与或涉及了 种代谢路径 其中生物钟调
控路径和植物次生代谢物路径等相关基因的发现,有助于深入研究黄曲条跳甲行为发生的内在机理。Solexa 高通
, ,
量测序技术作为昆虫功能基因组研究的重要手段 为发掘黄曲条跳甲功能基因发挥了重要作用 也为在分子水平
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