基于Solexa高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究.pdfVIP

基于Solexa高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究.pdf

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: 昆虫学报Acta Entomologica Sinica ,January 20 12 ,55 (1) 1 - 11 ISSN 0454 -6296 基于Solexa 高通量测序的黄曲条跳甲转录组学研究 # # * , , , 贺华良 宾淑英 吴仲真 林进添 ( , 510225) 仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所 广州 : Phyllotreta striolata (Fabricius) 。 , 摘要 黄曲条跳甲 是十字花科蔬菜的重要害虫 为深入了解其遗传信息 本研究应 Illumina ’s Solexa , SOAPdenovo 用新一代高通量测序技术 平台对黄曲条跳甲成虫的转录组进行测序 并结合 拼接聚 , EST 。 4 924 (contig), 2 209 类等分析软件 获取大量的 和挖掘功能基因 本文最终获得了 条序列重叠群 其中包含 Drosop hila melanogaster (unigene) 610 种与黑腹果蝇 蛋白基因具直系同源的独立基因 和 种黄曲条跳甲物种特有的 unigene 。 Gene Ontology (GO) , unigene (binding capability) 结合 数据库进行分析 发现大部分的 具结合能力 和催化 (catalytic activity); unigene 、 活性 上百种 可聚类于生物学过程分类中的配子发生 生殖腺发育和交配行为等重要功 。 , KEGG Pathway , 363 unigene 40 , 能 另外 结合 数据库分析发现 共有 种 参与或涉及了 种代谢路径 其中生物钟调 控路径和植物次生代谢物路径等相关基因的发现,有助于深入研究黄曲条跳甲行为发生的内在机理。Solexa 高通 , , 量测序技术作为昆虫功能基因组研究的重要手段 为发掘黄曲条跳甲功能基因发挥了重要作用 也为在分子水平

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