1株山东猪瘟病毒流行毒株全基因组的克隆与序列分析.pdfVIP

第 37卷 第 11期 西北农林科技大学学报 (自然科学版 ) Vo1．37 NO．11 2009年 11月 JournalofNorthwestAFUniversity(Nat．Sei．Ed．) NOV． 2009 1株 山东猪瘟病毒流行毒株全基 因组的克隆 与序列分析 吴旭锦 ，朱小甫 ，朱 辉 (1咸 阳职业技术学 院 生物科技系 ，陕西 咸阳 712000；2西北农林科技大学 动物医学院，陕西 杨凌 712100) [摘 要] 【目的】对分离 自山东的猪瘟病毒流行毒株 SD02进行全基 因组序列克隆分析 ，揭示 SD02分子生物 学特征，为猪瘟流行毒株分子流行病学研究积累资料 。 【方法 】根据 Genbank上发表 的古典猪瘟 Shimen毒株及 HCLV株全基 因序列，参考有关文献合成 12对引物 ，应用 RT—PCR技术 ，从 SD02毒株 的细胞毒 中成功扩增 出了 11 段 cDNA ，将这 11段 eDNA与pMD18一T载体连接并进行克隆、测序，测得的序列经过拼接得到全基 因组序列。将 SD02与 13株参考毒株 (39、ALD、Alfort187、Brescia、CAP、Glentorf、GPE、GXwZO2、HCLV、LPC、Parderborn、Riems 和 Shimen)的核苷酸序列及开放阅读框架编码 的氨基酸序列进行 比较 。 【结果】拼接后 SD02全长 12300bp，SD02与 13株参考毒株 的核苷酸序列同源性为 85．4 ～99．1 ；氨基酸序列 同源性为 92．5 ～98．8 。SD02与我 国Shimen 经典强毒株核苷酸序列 同源性高达 99．1 ，氨基酸序列 同源性为 98．8 。系统发生树分析表 明，SD02与 Shimen、 HCLV、Riems、Glentorf、Alfort187、ALD等毒株同属于GroupI。 【结论1SD02毒株在遗传特性和抗原性上仍属于经 典毒株 。 [关键词] 猪瘟病毒；全基因组；序列分析；sDO2株 [中图分类号] $858．28 [文献标识码] A [文章编号] 1671—9387(2009)1I-0007—06 Cloningandanalysisofthewholegenomesequenceofepidemic strainofSD02ofCSFV frOm Shandongprovince WU Xu-jin ，ZHU Xiao—fu 。ZHU Hui (1DepartmentofBiologyScience~Technology，XianyangVocationalTechnicalCollege，Xianyang，Shaanxi712000，China 2CollegeofVeterinaryMedicine，NorthwestAFUniversity，Yangling，Shaanxi712100，China) Abstract：[Objective]CloningandanalysisofthewholegenomesequenceofepidemicstrainofSD02 revealed theSD02molecularbiologyfeaturesandaccumulatedresearch dataformolecularepidemiologyof classicalswinefeverepidemicstrainvirus．[Method]AccordingtotheShimenandHCLV strains’whole genomesequenceinGenbank，andreferencestootherdocuments，12pairsofprimersweresynthesizedu— singRT—PCR technology，11eDNA wereamplifiedfrom theSD02strain successfully