巢式PCR及序列分析用于恙虫病早期诊断的实验研究.pdfVIP

巢式PCR及序列分析用于恙虫病早期诊断的实验研究.pdf

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2524 中国卫生检验杂志2009年 11月第 19卷 第 11期 ChineseJournal。fHealthLaborat。ryTechn。l0gyN。v2009;V0119 No 11 , 【实验研究】 巢式PCR及序列分析用于恙虫病早期诊断的实验研究 于昌军 ,张守印孙,李国兰 ,徐雷 ,张景山。,付秀萍 ,贺金荣 (1.安徽省阜阳市疾病预防控制中心,安徽阜阳 236030; 2.传染病预防控制国家重点实验室,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京 102206) [摘要] 目的:建立一种快速检测患者血液标本中恙虫病东方体的方法,用于恙虫病的早期实验室诊断。方法:收集患 者血液标本,提取全基因组 DNA;根据恙虫病东方体56kD蛋白编码基因特异基因引物 ,采用巢式PCR方法对其进行检 测,扩增的基因片段进行序列分析。结果:132份标本中,34份得到预期片段大小的PCR扩增产物,随机选取3份扩增产 物TA克隆后测序分析 ,证实PCR扩增产物为恙虫病东方体基因片段。结论:该方法灵敏、特异、快速,可直接用于患者 血液标本的恙虫病东方体特异性基因的检测 ,可为恙虫病东方体感染的早期诊断提供实验室依据。 [关键词] 恙虫病东方体;聚合酶链反应;序列分析 [中图分类号] R378 [文献标识码】 A [文章编号] 1004—8685(2009)l1—2524—02 Experimentalstudyforearlydiagnosisofscrubtyphusbynested——PCR andsequencea- nalysis YUChang-jun,‘ZHANGShou—yin“,LIG0“一lan,XULei,ZHANG ng—shah,FUXiu-ping,艘 fin—rong (1.FuyangCenterforDiseaseControlandPrevention,Fuyang236030,China;2.StateKeyLaboratoryforhffectiousDiseasePre— ventionandControl,NationalInstituteforCommunicableDiseaseControlandPrevention,ChineseCenterofrDiseaseControland Prevention,Beijing102206,China) [Abstract] 0bjective:TodeveloparapidmethodtodetectthepresenceofOrientiasutsugamushiinthebloodsamplesfrom suspectpatientsinfectedwithO.sutsugamushi.M ethods:ThewholebacterialgenomicDNA wasextractedfrom thepatientblood samples.TheprimerpairsusedforthenestedPCRweredesignedonthebasisofthenucleotidesequenceofthegenethatencodes the56一kDaantigen.ThePCRproductionsweresequenced.Results:34of132sampleswerepredictivegenesegmentsand3PCR productsweresequencedbyTA cloning.Thesequenceanalysisconfirmedthatthegenesegmentswereof0.sutsugamushi.Con- clusion:ItiSevidentthatthisassayisasensitive.specificandrapidmethodforthedetectionofO.tsutsugamushiinbloodsam— piesfrom suspectpatientanditcanbeusedofrtheearlydiagnosisofO.tsutsuga

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