基于线粒体cox1片段序列的胶州湾浮游动物DNA条形码分析.pdfVIP

第 42卷 第 5期 海 洋 与 湖 沼 VO1．42．No．5 2011年 9月 OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA Sep．，2011 基于线粒体 coxl片段序列的胶州湾 浮游动物DNA条形码分析 王敏晓 程方平 ，2 李超伦 孙 松 ① (1．中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室 山东胶州湾海洋生态系统国家野外科学观测研究站 青岛 266071；2．中国科学院研究生院 北京 100049) 提要 采用coxl基因特异扩增测序的方法，分析了胶州湾45种常见海洋动物的DNA条形码序列 82条，联合GenBank中28条coxl序列的分析结果表明：种 内个体间遗传差异均值为0．013(0—0．11)； 属内不同种间遗传差异均值为 0．265(0．137—0．369)，是种内遗传差异的20多倍，条形码间隙明显。 在分子系统树 中，所有种类的不同个体都聚成一个单系枝；coxl序列遗传差异在科、属水平发生重叠， 无法准确解析上述分类阶元的系统发育关系；但在更高分类阶元，cox1序列具有一定程度的解析能 力。利用 DNA条形码，本研究订正 了中国近海多个桡足类的命名。以上结果表明，线粒体 coxl基 因可 以作为DNA条形码实现浮游动物的准确鉴定。 关键词 胶州湾，浮游动物，coxl基 因，DNA条形码 中图分类号 Q958 浮游动物是海洋生态系统中连接传统食物链和 于标准化整合多种信息的中国近海浮游桡足类鉴定 微食物环的节点，处于物质 、能量的枢纽环节f李少菁 平 台。 等，2001)，是海洋生态系统中次级生产力的主要贡献 分子生物技术的发展使得基于统一特定简单标 者 (李强等，2010)，因此，深入研究该类群 的时空变 记的物种鉴定成为可能。具备合适分化速率的基 因即 化对于理解海区生态系统的结构功能具有重要意义 可成为物种鉴定 的理想标签 ，当种 内变异速率远远 (黄世玫，1983)。 小于种 问变异速率时，两个分类单元在遗传种 内和 胶州湾位于山东半岛南岸，水流交换频繁，受到 种问差异不会发生重叠，形成条形码 间隙(Barcoding 内陆和外海水系的影响，海产动植物资源比较丰富。 gap)，这就是区分两个种类的理论依据(Meyeretal， 根据 已有报道(孙松等，2008；黄世玫，1983)，胶州湾 2005)。线粒体编码 的细胞色素氧化酶第一亚基 浮游动物总计达 100余种，隶属于八个f-j：另有幼 (cox1)7OObp 的片段序列 目前被广泛应用于后生动物 虫、幼体 30余类 。由于涉及生物类群广泛，传统基 的种类鉴定 中(Hebe~etal，2003a；Frezaletal，2008； 于形态的浮游动物分析专业技术性强，操作费时、费 Stoeckle，2003)。虽然海洋生物 DNA条形码的工作开 力。此外，幼体丰度和分布的变化是了解关键种种群 展较晚，但近 l0年的工作表明cox1基因是多数海生 动力学的基础(Uyeetal，2002)；然而部分浮游动物特 动物种类鉴定的有效工具 (Radulovicietal，2010； 别是幼体形态高度相似，基于形态特征的种类鉴定 Bucklinetal，2010a；Jenningsetal，2010)。本研究采用 存在 困难 。因此，有必要建立起一套快速、准确、易 基于 coxI序列的DNA条形码技术，系统分析了胶州 国家海洋局海洋公益性行业科研专项，200805042号；国家重点基础研究发展计~J1(973)项 目，2011CB403601号；国家 自然 科学基金项 目，